目前疑似或確診猴痘個案，依據個案疾病狀況是否有重症或具重症風險因子，以及家中條件等因素綜合評估，若經臨床專業評估無住院治療照護之需要，且家中條件適合，可返家自主健康管理。
．重症或具重症因子包括：
1.有出血性疾病、融合型皮膚病灶、敗血症、腦炎、病灶位置導致需積極疼痛控制、合併細菌感染等。
2.有嚴重免疫不全（HIV感染且CD4<200 cells /mm3、白血病、淋巴瘤、全身性惡性腫瘤、器官移植等）等情形。
3.兒童（特別是1歲以下的嬰兒）、孕婦及哺乳婦女。
．居家條件：
1.可1人1室。
2.若家中有孕婦、未滿12歲兒童、80歲（含）以上長者、接受血液透析或免疫不全者等，需1人1室且有獨立衛浴設備。
二階段「居家自主健康管理」
疑似猴痘個案經綜合評估無需收治住院者，於依法通報並採檢後，得予以先行返家等待檢驗結果。個案出院返家後，如檢驗結果為陽性確診，由個案居住地縣市衛生單位聯繫通知個案陽性檢驗結果，並再次確認返家確診個案有無相關就醫需求，並依個案狀況進行後續住院或居家自主健康管理。
確診猴痘個案經綜合評估無住院收治需求者，可返家進行二階段「居家自主健康管理」，倘個案在居家自主健康管理階段，因疾病狀況有住院或就醫需求，地方衛生單位應予以協助。
．第一階段自主健康管理：出院返家後至符合以下所有條件；地方衛生單位應至少每2日追蹤關懷個案。
1.至少72小時沒有發燒。
2.在過去48小時內沒有出現新的病灶。
3.露出部位皮膚病灶（包括臉部、手臂及手部）都結痂，且可完全被遮蓋（例如: 使用衣物、紗布、OK繃等蓋住）。
4.口腔黏膜沒有病灶。
．第二階段自主健康管理：符合結束第一階段自主健康管理至結案，結案條件為符合以下所有條件；地方衛生單位應至少每週追蹤關懷個案。
1.至少24小時沒有發燒。
2. 在過去48小時內沒有出現新的病灶。
3.所有病灶（露出/未露出）都結痂脫落，且下方長出一層新的皮膚。
4.沒有黏膜病灶。
而自主健康管理期間，若全身皮膚病灶尚未完全結痂脫落，病況仍具傳染他人之虞，故針對未遵守防疫事項，而有傳染他人之虞個案，地方衛生主管機關於必要時，得依傳染病防治法第44條規定實施隔離治療等強制措施。
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