校長染紅騙兩岸3／強升祕書、護航徇私爭議多 陳同孝遭控染紅違學倫回應了
除了染紅，陳同孝還有不少爭議。之前他就被控強升九職等女祕書擔任十職等專門委員；讓僅有碩士學歷、專業也不是外語的教師，擔任進修學院的外語科主任，遭監察院關切；幫友好的教師申請永久免評鑑、護航升等；推薦性侵女職員的教師，擔任行政院公共工程委員會的採購評選委員，被教育部得知後撤銷提名。但台中科大均否認，強調校長在人事及行政上均合法合規。
本刊調查，國立大學遴選校長時，就曾因候選人「染紅」發生類似爭議！之前台科大校長候選人、台大化工系教授李篤中，就遭控違法赴中國兼職、拿中國經費做研究，後來李雖退選，但本刊追查發現，李疑似未向教育部報備，連續11年主持至少4個中國國家自然科學基金委員會補助的研究計畫，總金額超過新台幣千萬元，涉嫌違反現行《兩岸人民關係條例》。
教育部接獲檢舉之後，啟動調查，結果發現2009年起，李篤中以中國哈爾濱工業大學名義，申請中國國家自然科學基金委員會3項研究計畫補助，皆未獲主管機關許可，經查證屬實，最後是依《兩岸人民關係條例》規定，處新台幣30萬元罰鍰。
教育部指出，兩岸學術交流僅限於短期客座講學，中方不得聘任我方人員擔任教職或研究職務，且應依《兩岸人民關係條例》《教育人員任用條例》等法規辦理，參與中國各項國家基金及國家重點研發工作、現職公私立專任教師赴中國任教、為中國教育機構在台辦理招生或居間介紹，均明文禁止。台中科大校長陳同孝明顯踩到法律紅線，教育部有必要徹查到底，維護學術尊嚴。
針對相關指控，本刊致電台中科大祕書室查證，中科大回應如下：
近年來，校內某些人士為達特定目的，長期躲暗處透過媒體投書或向教育部、監察院等投訴本校或陳校長，進行一連串的抹黑，然屢屢查無不法，本次貴刊接獲投書內容，與之前投書媒體或檢舉案內容雷同，內容明顯悖離事實。
本校陳校長與洪姓學者學術合作十餘年，部分研究案因而重疊，但在各領域申請個人國科會計畫案，校長並未向中國大陸申請計畫暨補助經費，此指控為子虛烏有之錯誤訊息，要知，一位國立大學校長申請中國大陸官方計畫，教育部等相關部會怎可能置若罔聞；另洪姓學者多年前確曾赴陸指導一名陸籍大學學生，因合作研究案，論文有所交流，恐因而造成誤會。
再者，所指在國際及中國大陸期刊發表內容高度雷同文章，並分別於兩地申請補助，一稿二投違反學術倫理一事，更是莫虛有的指控。校長發表國際期刊論文皆為英文，中文論文對其毫無助益，更沒必要大費周章選擇以中文發表，故何來一稿二投及後面申請計畫之事。
有關於中國大陸期刊發表中文論文一事，校長強調個人全然不知情。他說明任何兩岸學術交流活動，如國籍加上中國2字，個人立場一定嚴加要求更正，否則取消合作。且所謂自稱中國安徽霍邱人一事，還是因投書和檢舉案，才知有此一事，無疑平白被冠上矮化國格之名。
近年來，臺灣高等教育面對內外環境同步變革的挑戰，本校在校務治理上，為求永續發展機會，擬定策略以回應社會對教育品質及辦學績效的要求，教師面對學習生態的改變及角色轉變，勢必有所作為，造成部分教師壓力，學校期盼各方共同努力，打造和諧共榮的校園環境。
本案所訴之事，對方企圖混淆視聽，從之前的檢舉，到如今的惡意投訴，種種不實指控，雖最終還以清白，但皆耗費時間與心力應付，要知，如有所指不法情事，早遭教育部及公部門調查與糾正，為避免以訛傳訛，造成誤導，特此提出說明。