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新發現:動物複雜生命早在 6.5 億年前即已啟動「遠端基因開關」

明日科學

更新於 2025年05月13日12:05 • 發布於 2025年05月13日12:00 • 高 詩豪

最新發表於《Nature》期刊的一項研究發現,遠距基因調控(distal regulation)機制在約 6.5 億年前的動物演化早期(成冰紀,Cryogenian)即已出現,遠比原先認為的提早了約 1.5 億年。遠距基因調控指 DNA 能以特殊的立體結構折疊,讓相距數萬個鹼基的片段相互接觸,藉此遠端啟動特定基因的表現,有助於生物發展出不同功能的細胞及組織,毋須大量創造新基因。

西班牙基因調控中心(Centre for Genomic Regulation)團隊研究梳水母(如淡海櫛水母 Mnemiopsis leidyi)、扁盤動物、刺胞動物及海綿等動物界最早分化的支系,以及動物近親的單細胞生物,利用 Micro-C 技術繪製出 11 種物種的 3D 基因體折疊圖譜,結果發現:單細胞近親缺乏此機制,早期分支的動物卻皆具備遠距基因調控能力。

使早期多細胞動物如「瑞士刀」般靈活運用基因

照片顯示的是一隻異常大型的淡海櫛水母(Mnemiopsis leidyi),具有兩個反口端(aboral ends)與兩個頂器(apical organs),為罕見的發育異常個體。淡海櫛水母屬於櫛水母門,以其透明凝膠狀身體與可反射光線的櫛板結構著稱,是研究早期動物演化的重要物種之一。(圖/Jokura)

研究發現,梳水母雖然基因組僅約 2 億個鹼基,卻已有超過 4,000 個 DNA 環狀結構,此一發現挑戰過去「遠距調控最早出現於約 5 億年前兩側對稱動物共同祖先」的主流假說。團隊推測,遠距調控的提前演化,可能使早期多細胞動物如同「瑞士刀」般靈活運用既有基因,促進了動物演化早期階段的生態多樣性。

研究人員表示,梳水母可能代表動物演化樹更早的分支,遠距基因調控的出現時間亦隨之推前,為解開動物生命複雜性的起源提供了新線索。

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http://www.tomorrowsci.com

首圖來源:Christoph Bock, Max Planck Institute for Informatics(CC BY 4.0)

圖片來源:Jokura et al(CC BY 4.0)

參考論文:
1、Chromatin loops are an ancestral hallmark of the animal regulatory genome

Nature

延伸閱讀:
1、為何人類不像其他動物毛茸茸?關鍵在「基因開關」

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