國家衛生研究院癌症研究所陳尚鴻助研究員級主治醫師及共聘研究員級主治醫師李健逢進行合作，運用次世代定序技術檢測分析保存在奇美醫學中心的乳癌組織，剖析台灣乳癌細胞常見基因變異及其潛在臨床應用，相關研究成果發表在 2024 年國際知名學術期刊《Cancer Medicine》。
乳癌是台灣女性癌症發病率最高的癌症，也是女性癌症死亡的主要原因之一，台灣每年有超過 1 萬名女性被診斷出乳癌。根據 2022 年衛生福利部統計資料顯示，台灣未滿 50 歲的年輕型患者人數約占所有乳癌患者的 32%，為歐美國家的 1.3 倍，顯見早期發現的重要性。
乳癌治療涵蓋手術、化學治療、放射治療、標靶治療和免疫療法等多種方式，由於乳癌的亞型多樣化，不同的亞型會有不同的預後和治療反應，為建立台灣乳癌腫瘤組織的基因變異圖譜，幫助每個患者根據癌症類型和基因特徵來量身訂做治療計劃，國衛院特地繪製基因變異圖譜。
乳癌患者在臨床治療藥物的選擇，可依據荷爾蒙受體，包含雌激素（ER）及黃體素（PR）兩種，以及第二型人類表皮細胞受體（HER2）的表現分類為三種，包括荷爾蒙受體陽性、HER2 陽性及三陰性乳癌。
為了貼近此三種不同亞型於真實世界樣貌，研究團隊分析 116 份台灣乳癌檢體，經過 440 個致癌基因的檢測，發現常見突變致癌基因，包含 PIK3CA（39.7%）、TP53（36.2%）、KMT2C（9.5%）、GATA3（8.6%）、SF3B1（6.9%）、DNMT3A（5.2%），以及 MAP3K1（5.2%），顯示台灣乳癌常見致癌基因突變與西方國家患者相似。
依據基因檢測的分析結果，帶有不同突變致癌基因的患者，在標靶藥物的選擇也有不同，例如 PI3K 或 AKT 抑制劑適用於帶有 PIK3CA 突變的晚期荷爾蒙受體陽性患者，而帶有 AKT 或 PTEN 基因突變的晚期荷爾蒙受體陽性乳癌患者，可考慮接受 AKT 抑制劑之治療。
帶有致病性 BRCA1/2 突變的晚期荷爾蒙受體陽性及三陰性乳癌患者，可考慮選擇 PARP 抑制劑作為治療選擇，而這項研究中有兩例檢測結果為腫瘤突變負荷（Tumor mutation burden，TMB）高表達晚期乳癌患者，可以考慮選擇 PD-1 抑制劑治療。
研究團隊發現有 4 例臨床檢測非 HER2 陽性腫瘤組織呈現 HER2 基因放大的結果，藉由原位雜交技術（in situ hybridization）證實此 4 例腫瘤組織應分類為 HER2 陽性乳癌，研究結果顯示，基因檢測可為約 39.5% 台灣晚期乳癌患者提供治療選擇的幫助，作為台灣乳癌臨床治療參考，並有助於乳癌標靶藥物的開發。
（首圖來源：國衛院）
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