國內第四波疫情再起，確診數上升，加上指揮中心解編後，醫療院所原先使用的簡訊通報回歸紙本作業，導致基層感染管控師業務量爆增為疫情前的2倍，包括台大等各醫學中心管控師不滿工作量大增，醞釀離職潮，另外像是藥局快篩試劑也開始出現買不到的情況。
國內第四波疫情再起，儘管輕症免通報，但近期快篩的需求量再度增加，民眾反應跑了好幾家藥局都買不到，台北市藥師公會發言人王明媛說：「我們大概從5月開始就發現，民眾對於快篩的需求確實有增加，那我想這個還是跟我們隔離政策改變，大家在脫口罩的這段時間，所謂的「免疫負債」感染的人越來越多，我自己也是突然一下子被買完之後，像我們就有在這禮拜陸續進貨，其實供應量是沒問題的。」
不只快篩需求增加，5月新冠疫情降階後，醫療院所通報確診，也從原先使用的簡訊通報，回歸紙本作業，導致基層感染管控師業務量，爆增為疫情前的2倍，部分醫院的感染管制師，不滿工作量大增醞釀離職潮，台灣感染管制學會理事長陳宜君說：「我們得到的(公文)訊息是回歸紙本世代，某些紙本只要是進到隔離病室裡面，給確診病人或他的家屬簽署，再回出來的話，這個紙其實可能會有潛在污染的風險，承接這麼多複雜的國家的，要求的期待的任務，其實是非人可以做的。」
醫院收治確診有隔離需要的病患，必須先由感管師請主治醫師，填寫隔離治療建議單並蓋上醫師章，再由感管師以電子郵件寄到地方衛生局，等待衛生局回函新冠隔離治療通知書後，以紙本送達個案或家屬簽收，整份公文流程必須在24小時內完成，如果未完成通報，不只可依傳染病防治法開罰，紙本往來恐怕還會造成染疫風險，台灣感染管制學會理事長陳宜君說：「24小時還牽涉假日那你要專人(服務)，但是我們每一個人身上都有很多案子，我們每個感管護理師，以台大來講要照顧6-8個單位，他同時我們要撥出人力來，承接法定傳染病的通報。」
對此疾管署表示，原先電子開單系統已去任務化，但目前已在研擬改善方案，以減輕醫院行政負擔，包括24小時內須通報及開單規定，預計將放寬為72小時最快本週上路。
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