日本警方於1月25日在奈良縣與大阪府交界的深山一間廢棄空屋，發現一具赤裸被肢解的男性遺體，頭顱失蹤。警方於2月3日以非法遺棄屍體拘捕28歲無業男子大木滉斗，其後證實死者為52歲的公務員神岡孝充，並於同日尋回死者的頭顱。疑犯更被發現曾以死者的提款卡提取現金。
綜合日媒報道，死者神岡孝充為國土交通省職員，於航空保安大學任會計課長。他與疑犯居住在同一棟大廈的不同樓層，未知兩人是否相識及他們的關係。
報道稱，平常獨居的神岡孝充於去年12月底失蹤。他原定於12月27日完成工作後，前往菲律賓與在當地定居的妻子見面。他的妻子於12月29日報警稱丈夫失去聯絡。警方於1月1日前往神岡的住所調查，發現他不在家，屋內亦沒有被闖入的痕跡。
警方其後透過閉路電視，發現疑犯大木滉斗曾於去年12月28日，拖著懷疑藏有屍體的行李箱，乘搭電車到近鐵額田駅，再步行約700米到東大阪的山區。調查人員又於便利店的閉路電視片段，發現疑犯1月10日在櫃員機以死者的提款卡提取現金。
警方於2月2日在和歌山縣白濱町拘捕疑犯，他向警方供稱將死者的頭顱放置在大阪市中央區某住宅大廈內，警方最後在該處發現死者頭顱放置在保冷袋內。法醫官驗屍後，初步指死者是因窒息死亡。
日本傳媒引述死者神岡孝充的同事指，他平常待人和善，會親切細心地指導後輩，遇到棘手的工作也會盡全力去解決，並沒有與人結怨。