中央疫情指揮中心執行立法院在台灣機場設立快篩站決議，以降低離島防疫壓力，核定自6月2日起，搭乘華信航空班機，由松山、台中及高雄等機場前往澎湖、金門的旅客，應於航班起飛前90分鐘，攜帶身分證及健保卡至機場報到，以免延誤搭機影響行程。
華信航空也提醒本島機場將設置篩檢站，有新冠肺炎症狀者需接受核酸檢測，不得登機。另外，搭機前14天有疑似症狀者需接受篩檢，採檢陰性才允許登機；報到前需填寫「嚴重特殊傳染性肺炎國內線行安旅客健康聲明書」交航站人員檢查，且旅客應於現場櫃臺或自助報到櫃台辦理報到，並繳交健康聲明書，同時也將暫停受理網路報到服務。
不過，昨（2）日上午華信由高雄飛澎湖的班機，總共31名乘客，全都沒有在高雄機場接受快篩，而是入境澎湖機場時才接受快篩。由此可見，中央疫情指揮中心決定在台灣5個飛航離島的機場設置快篩站，但顯然機場快篩承辦人員並未確實執行，都是應付上級規定虛應了事，完全抹煞中央的好意。如果放任旅客入境澎湖再快篩就失去意義和功能，勞民傷財毫無防疫效果可言。
陳姓民眾出示他在高雄機場填寫的健康聲明書並表示，航空公司通知他要提早1個半小時到機場櫃檯報到，到機場後有人遞給他一張表格，他填寫後交給櫃台人員檢查，之後再也沒人招呼他或宣導機場快篩事宜，隔不久就登機飛來澎湖了。
縣府發言人陳其育表示，有電視媒體報導乘客抱怨在台灣機場接受快篩，入境澎湖還要再篩一次，感覺很麻煩也沒必要，這完全是子虛烏有。他說，上午搭機到澎湖的旅客全都沒有在台灣機場快篩，怎麼可能會有篩兩次的現象；凡是在台灣機場快篩的乘客人境澎湖時，只要出示台灣機場快篩證明，就不必在澎湖機場快篩。
- 旅客在澎湖機場快篩站排隊等候篩檢。（李三祿攝）