邱琦雯結束八點檔拍攝後，身體驚現警訊，因而開始積極健身計畫，除了每週固定夜跑6公里，還報名同門師兄潘若迪的有氧課程。她回憶一開始是手指頭浮腫脹痛，有時甚至痛到無法入睡，後來連白天幾度都快要暈倒，才意識到嚴重性，連忙就醫檢驗，竟檢查出免疫系統出問題，全身都在發炎，她無奈說：「那時每天都吃消炎止痛藥，但吃藥傷身體，身體更容易浮腫。」為了治本，她開始強迫自己調整作息，並養成運動習慣增強免疫力。
邱琦雯先調整睡眠作息，讓自己每天必定睡滿8小時，也調整飲食，吃抗氧化的酪梨、優質澱粉的紫色地瓜。此外，在朋友建議下開始嘗試慢跑，從起初跑不了太遠，到現在每次跑6公里，她說：「運動後氣色變很好，這讓我很開心。」跑出心得後，還動念參加馬拉松賽事。同門師弟游書庭更邀約她一起上潘若迪的有氧課程。
邱琦雯坦言沒上過有氧課，行前有點擔心體力無法負荷，但在游書庭陪伴，以及潘若迪超嗨帶動風格，搭配妙語如珠的順口溜，邱琦雯不知不覺上完整堂課，她笑說：「從上課開始音樂一下，潘老師讓我high到結束，他的能量很強，會讓我笑著做完運動。」儘管自認跟不上，覺得手腳不協調，但潘若迪仍給邱琦雯很大的肯定，大讚她堅持到最後，而且律動感很好，給她打上90分的好評價。 邱琦雯透露，過去寧願少吃也不願運動，但這次身體出狀況反而因禍得福，愛上運動的感覺，她招認：「以前沒運動，臉色都泛黃，不敢素顏出門。」而現在上個底妝，朋友就覺得自己氣色很好，這些轉變都是始料未及。現在身體各項檢查數值都回復正常，她動念挑戰游泳，她過去曾報名游泳班，不料卻在換氣卡關，「我可以一口氣游很遠，但只要一換氣，身體就會下沉」，到最後連教練都放棄，直接讓她退費，現在她對運動有信心，期許自己有朝一日成為水中嬌龍。
