法務部日前研擬《財團法人法》，行政院發言人徐國勇點名蔣經國基金會與中技社，政府獲配董監事席次偏低，讓政府捐助財團法人再度成為焦點。
根據主計總處統計，政府捐助財團法人到2016年為止共有165個，其中，政府累積捐助金額低於5成者一共43家，其餘122個必須將年度預算送立法院審查。《風傳媒》統整各部會下轄之財團法人，將基金規模與政府捐助比例全數公開。
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內政部
內政部下轄財團法人除了二二八基金會外，尚有義消基金會等共7家。
外交部
外交部下轄台灣民主基金會、國合會等3家財團法人。
國防部
目前國防部之下有國防工業基金會1家財團法人。
教育部
教育部下轄的財團法人，包括大考中心、高教評鑑中心等11家。
法務部
法務部統轄的則有犯罪被害人保護協會、台灣與福建更生保護協會。
經濟部
經濟部轄下政府捐助財團法人數為各部門之冠，有中經院、工研院、中興社等共20家。
交通部
交通部下轄郵政協會、電信協會、航空基金會等6家財團法人。
衛福部
衛福部下轄國衛院、藥品查驗中心等10家財團法人。
文化部
文化部下轄中央社、央廣等12家財團法人。
科技部
隸屬於科技部之下的財團法人有國家研究院等2家。
蒙藏會
蒙藏會下有蒙藏基金會1家財團法人。
僑委會
由僑委會管轄的，則有海華文教基金會、海外信用保證基金2個財團法人。
環保署
環保署轄下有環資會以及環發會2家財團法人。
陸委會
陸委會管轄的有海基會、台港策進會2家財團法人。
金管會
金管會所屬的財團法人，包括投資人保護中心、保險事業發展中心等7家。
退輔會
退輔會下轄榮民榮眷基金會。
原能會
原能會管轄的2家財團法人，分別是輻射防護協會、核能資訊中心。
農委會
農委會下轄豐年社，其期刊《鄉間小路》已轉型為網路媒體《農傳媒》；此外尚有農發會、農村發展基金等共26個法人為農委會管轄。
原民會
原民會下轄負責經營原民台的原住民族文化事業基金會。
通傳會
隸屬於通傳會（NCC）的是財團法人電信技術中心。