縣長賴峰偉為了有效防堵COVID-19入侵，確保民眾安全及維護醫療體系運作順利，1日起強勢展開入境旅客全面篩檢工作；不論民航機還是軍機組員，都隨著入境旅客一同接受機場快篩服務，讓工作人員士氣大振，執行任務也充滿信心。
賴峰偉宣示6/1啟動入境旅客全面篩檢機制，縣府防疫團隊繃緊神經、不敢大意，由縣府秘書長盧春田領軍守在機場各關卡，盯緊每個出關旅客。
由於宣導得宜，旅客都依照篩檢動線排隊填寫聲明書，再到等候區依序快篩，秩序良好沒有造成混亂；雖有少數幾個民眾說要趕時間辦事，不耐久候急著想脫隊離去，在盧春田及參議馬金足、衛生局長蕭靜蓉等人道德勸說下，最後也都欣然留下接受快篩，總算沒有漏網之魚。
賴峰偉對於旅客願意配合維護澎湖安全，犧牲個人時間在機場接受快篩，表示肯定與感謝；同時也感激議長劉陳昭玲、立委楊曜及各界大力支持，讓防疫人員可以在機場實施全面快篩，期盼第一時間就能阻絕病毒，避免疫情擴散，有效保障鄉親生命財產安全。
快篩首日出現幾個插曲，由於上午快篩站有1位醫師臨時請假，人力吃緊導致旅客排隊等候時間較久，所幸蕭靜蓉緊急調派人手支援，順利完成任務；不過也有民眾質疑，旅客大排長龍違反「不得群聚」規定，應該保持安全社交距離才是。
此外，澎湖航空站主任邱永昇認為，中央流行疫情指揮中心（下稱指揮中心）只准旅客自願快篩，縣府不能牴觸中央規定，在交通部所轄航空站進行強制快篩，蕭靜蓉遂將「全面快篩」公告取下，換上「自願快篩」平和收場；即便如此，防疫人員仍然積極勸說入境旅客接受快篩，想方設法完成任務的精神值得按讚。
5月31日立法院審理紓困條例，附帶決議要求指揮中心於紓困條例修正案通過後1週內，針對通往離島之本島機場及港口設置快篩站，對進入離島民眾進行全面篩檢；據此，賴縣長也強調6月1日至中央設立臺灣機場快篩站期間，入境澎湖旅客必須全面快篩，否則就要開罰。
不過，指揮中心指揮官陳時中並不同意，他認為強制旅客快篩違反法規，故表示近日將發函，撤銷離島「拒絕快篩者依傳染病防治法開罰3千至1萬5千元」公告。陳時中說，這方案因不合規定，已通知三離島縣府將其撤銷，但改為「若有症狀就在臺灣登機或搭船時就須快篩或直接做PCR檢測」。
陳時中說，在疫情期間須按依照指揮中心規劃辦理防疫措施，因澎湖縣、連江縣和金門縣的措施未經過核准，因此撤銷公告，但指揮中心也改為在國內5個機場設立快篩站，若當下有症狀就不能搭飛機。
儘管中央指出強制快篩違法，縣政府發言人陳其育1日下午表示，離島醫療資源與台灣本島有很大落差，如果中央不能保護澎湖，請不要阻礙澎湖自我保護，為了澎湖民眾的健康，縣府將持續採取入境澎湖全面快篩。
- 旅客依照篩檢動線排隊接受快篩。（縣府提供）
- 盧春田道德勸說旅客不要離開。（縣府提供）
