美、日援助以及台灣自購的進口新冠疫苗開始到位，接下來，國產的高端疫苗預計6月10日前後公布解盲結果，若順利取得緊急使用授權程序（EUA），最快6月底前可交貨、提前開打。只是，雖有5月30日獲得政府採購訂單500萬劑的公告撐腰，但5月31日起至6月4日，高端股價卻連吞5根跌停板，顯見市場與人民對國產疫苗有信心疑慮。
高端未做3期臨床試驗即可能緊急使用打在國民身上，以及蔡英文政府力挺國產疫苗，遭受「謀財害命」的質疑。但至今，總統蔡英文「手臂留給國產疫苗」的決定未變。究竟當初蔡政府為何相中高端疫苗？又何以民心反彈至此，蔡英文仍支持國產疫苗，像是吃了秤砣鐵了心？
政府高層指出，2020年初新冠肺炎疫情爆發後，台灣與美國政府隨即暗中展開防疫合作，而於地緣政治的敏感與特殊性下，「我們一定要想辦法做自己的疫苗」，才不會受制於人，於是必須找一個夠合格的廠商，而高端是少數早期就與美方接觸新冠疫苗製造的業者。
政府高層：台美國安防疫啟動，美國技轉高端更積極
高層表示，政府相中起步早的高端計畫，之後也因為台美國安防疫的啟動，高端與美國國家衛生院（National Institutes of Health，NIH）的鏈結更為緊密。
在台美防疫合作下，高端於2020年5月與美國國衛院簽署新型冠狀病毒疫苗全球商業授權合約；8月，美國衛生及公共服務部（US Department of Health and Human Services）部長艾薩（Alex Azar）訪台。
政府高層指出，艾薩來台其中一項任務，就是更進一步確保由美國暗中提供莫德納（Moderna）「孿生兄弟」疫苗的技術給台灣，以達成台美防疫合作中，「台灣作為全球醫療設備和關鍵技術的可靠供應者」目標。高層表示：「後續美國技轉高端變得更積極，就是國安層級的台美防疫合作啟動。」
技術不同，高端真的是莫德納的「孿生兄弟」嗎？
只是，高端與國衛院合作的這支新冠疫苗是否為莫德納「孿生兄弟」，卻備受質疑。因莫德納是mRNA疫苗，而高端為重組棘蛋白疫苗，二者技術不同，為何蔡英文政府將高端當成莫德納的「孿生兄弟」，視之為寶？
高層表示，這兩支疫苗，都是由美國國衛院完成關鍵技術轉移，二者就是系出同源，這有什麼錯？
台灣感染症醫學會名譽理事長、台大兒童醫院院長黃立民接受《非凡新聞》訪問時曾表示，高端疫苗所使用的蛋白是跟莫德納用的蛋白是一樣的，莫德納是把它做成mRNA的形式，高端做成棘蛋白的形式。
幫忙實驗室做高端、AZ、莫德納疫苗測試的長庚大學新興病毒感染研究中心主任施信如接受《信傳媒》電訪，對於美國國衛院為何從全世界疫苗公司中挑中高端來開發製造銷售時稱，高端授權（源）於美國國衛院，「設計是跟莫德納一樣，只是莫德納是mRNA疫苗，高端把他變成較傳統的棘蛋白疫苗。」
另一方面，蔡政府挺高端疫苗爆出炒股陰謀論，尤其高端疫苗的成立背景與基亞生技息息相關，為高端最大股東的基亞董事長張世忠家族，其基亞生技十多年前曾經研發肝癌新藥，吸引投資人買賣股票，股價最高到達486元、市值突破600億元，但是2014年卻因為一份期中分析報告，戳破生技大夢，引發連續19根跌停。基亞曾經造成股市軒然大波，蔡政府在選定合作之前，是否查過高端與基亞的「前世今生」？
政府高層表示：「這些都查過。」該人士說，高端和基亞雖然老闆是同一個，但高端研究團隊跟當時基亞團隊已經不太一樣了。
為何不做代工？高層：國產疫苗若成功將領先日韓
只是，外界也質疑，台灣為何一定要自己研發疫苗？台北市長柯文哲直言，如果是他，會採用韓國戰略，一開始就去做代工，因為代工是台灣強項，不用搶專利，「自己做品牌很吃力，為什麼要把國運賭在冒險上面？」
中央流行疫情指揮中心陳時中表示，本來代工的部分有在談判，但後來還是功敗垂成。蔡英文政府防疫幕後最高顧問，世界公衛專家、前副總統陳建仁指出，若未來疫情流感化，台灣擁有自製疫苗的能力，才會有更多的應對空間。蔡英文則說，以現在國際疫苗的供給情況，如果台灣沒有自己的供給能量，就會處處「受制於人」，因此擁有自己可以供應的疫苗，是國家戰略的優先項目。
政府高層表示，若高端、聯亞能成功，台灣將是日、韓、台裡唯一有自己疫苗的國家。
蔡英文政府視疫苗為國家戰略，也因與美方技術合作，對國產疫苗有相當自信。只是政府有信心，人民卻疑雲滿天。國產疫苗能不能上場還猶未可知，且還未出場就成為防疫的另一個危機，恐也是蔡政府當初所始料未及。（推薦閱讀：批藍營天天吵罵、甘為中共犬馬 曹興誠：人人應對防疫中心成績心懷感恩）
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