民眾黨主席柯文哲台北市長任內的北士科、京華城案爭議延燒，台北地檢署也介入調查，並將柯文哲列為被告。對此，前立委蔡正元在政論節目《鄉民大學問》表示，全台灣沒有建商會依法定容積蓋房子，京華城加上依法申請容積移轉30％後，允建容積率合計為840％是合理的；柯文哲不僅會獲判無罪，聲量也會因此提高。
針對京華城土地容積率在柯文哲任內暴增，被外界質疑圖利京華城，蔡正元指出，有許多計算方式是錯誤的，法定容積率確實是560％，但事實上全台灣沒有建商會依法定容積蓋房子，而是會加上許多獎勵容積，包括開放空間與停車場等，否則一定會虧錢。
蔡正元續指，若法定容積率照560％計算，京華城另依法申請容積移轉30％，最後允建容積率合計為840％是合理的；舉例來說，遠東百貨寶慶店的法定容積率是800％，加上所有獎勵容積超過1000％。
至於柯文哲任內通過的北士科設定地上權案爭議，蔡正元認為，北投、士林的開發模式其實是比照內湖、南港，以內湖的「中國信託金融園區」為例，推出新賣場時並無人購買，最後經濟部與中信金簽了80年，那要不要告經濟部長？此外，疫情結束後，南港房地產意外大幅上漲，要不要告圖利中信金暴利？（推薦閱讀：幕後》水很深！原鎖定行政院長級人物 檢調查BNT疫苗案踢出醫藥界黑幕）
不過，蔡正元補充，這就是政治鬥爭，柯文哲應該要歷練，被告的次數越多，就會越接近總統的位子，如同前總統馬英九，也是在被告貪污後不久當選，並表示柯文哲不但不會被判有罪，反而因此在久未曝光的情況下，獲得提高聲量的機會。