先前《漫威蜘蛛人》「移除彩虹旗」模組作者被祭出永久停權的處分就在玩家之間引發了不小的論戰。Nexus Mod 站方當時並未明顯表態，但現在官網發布最新公告，站長 Robin Scott 親自出面談論爭議，表明自現在開始，任何試圖「反對包容性或多元化」的模組一律封鎖，甚至要求任何對於規定感到不滿的玩家把自己的帳號刪掉。並同時鼓勵玩家協助檢舉所有疑似違規的模組創作，但強調最終的決策權仍然握在站方手中。
「我們無權限制用戶能夠或不能使用什麼樣的模組。將模組下架僅代表了玩家無法在 Nexus Mod 網站上找到僅是如此。此外得表明我們並非唯一會移除模組的平台。身為私人企業有權決定內容。請尊重我們的權利，如同你們希望自己的權利被人尊重一樣。我們不想也不會跟你們起爭執，現在已經解釋了我們的立場，而我們並不打算提供一種能夠扭曲立場的平台，避免助長任何不理智或偏執的敘述。你們可以去其他地方，到一個根本不會在乎你們寫了什麼的地方。如果政策讓你感到不爽，打破了某種讓你們無法接受的商業道德原則，請你們把帳號刪了，然後像我們一樣放下。」
Robin Scott 在聲明中談到了將製作「移除彩虹旗」模組的玩家永久停權的決定，將他永久停權是「再簡單不過」的決定，主因就是模組製作者在上傳模組時刻意使用分身帳號，意味本人一開始明白這套模組可能 Nexus Mod 網站上引發的爭議及不恰當性。即使已從 Nexus Mod 網站下架，但玩家目前依然能夠在其他地方找到下載的位置。
另一方面，Nexus Mod 網站的《漫威蜘蛛人》頁面上已經充滿了其他有趣的模組，符合了玩家在登上 PC 平台後的期望，像在遊戲中加入一套共生體風格的黑色戰服，或將蜘蛛人改成瑪麗珍、金霸王、黑貓和史丹李，甚至讓玩家扮演「班叔的墓碑」四處打擊犯罪，由他本人來親自發揮能力越強責任越大的精神。