新黨中壢區立委參選人游智彬近日爆料，民進黨立委莊瑞雄碩士論文涉嫌抄襲，經比對系統結果呈現高達57％雷同，圖表順序更是複製貼上。對此，莊瑞雄今（12/28）隨即發出聲明反駁，並表示，游智彬顯然對於DEA研究方法與論文撰寫，完全不理解，輕易指控，意圖政治操作與引起關注，實為不當之舉。
游智彬指出，莊瑞雄的碩士論文《北高兩市市立綜合醫院之經營績效評估》抄襲率57%，其中有53%的內容抄襲自薛環琪發表於2004年6月的碩士論文《台灣各縣市環保機關績效評估-公害陳情處理及便民措施之研究》。而莊文發表於2005年6月，比該論文晚了整整一年。依論文完成的時間先後來說，莊瑞雄顯然有充足的時間抄襲他人著作。
對此，莊瑞雄表示，先嚴日前辭世，治喪期間暫停所有對外發言，但他不得不回應游智彬的不實指控。他強調，自己的論文採取的DEA研究方法，屬於成熟學術典範，論文採取此方法，重點在於研究的數據內容，與研究最終結論。研究過程如同研究手冊，按照每一步驟標準執行，最終得出結論，沒有所謂抄襲指控。
莊瑞雄說，游智彬所指控的「參考文獻一樣」，但參考文獻一致與抄襲完全無關，參考資料顯示作者對於研究內容的研究與搜集，他的論文是量化分析，若僅針對研究方法與文獻部分胡亂進行指控，就忽略量化分析研究最重要精神，而論文最重要的是有新的研究發現與結論，游智彬卻隻字不提，是刻意栽贓誣陷。
莊瑞雄說，對方指控他研究內容相似，但他的論文是國內少數對於醫院管理，以及對北高兩地進行比較的研究論文，後續研究引用證實首創與獨到，研究人員也引用此論文進行新的研究，拓展學術領域。
莊瑞雄強調，學術比對分析系統是學術研究一大突破，但目前僅能針對相似字句標示，無法精準說明是否抄襲，像是校名、系名、用註釋皆會標示，只以系統數字作為指控的依據，極為不當與草率。
