除了財產來源可能不明，林姿妙的另個燙手山芋是被羈押禁見的同案被告、縣府建設處代理處長吳朝琴及農業處農務科長吳東原，二人因羅東土地免徵增值稅涉嫌圖利地主，原本該筆鄰近羅東運動公園的土地屬於非農地農用，並被縣府列管在案，縣府後來竟解除列管，還核發農務證明，讓地主不但符合農地買賣規定，甚至免繳100多萬元土地增值稅。
吳朝琴遭約談時的證詞對林姿妙極為不利，他咬出2019年間，林姿妙指示他處理此案，並要他辦完事後再報告，後來他交辦吳東原協助辦理土地變更，不過後續狀況未再向林回報，雖然此案圖利金額不高，但林姿妙遭部屬緊咬，真相有待檢調釐清。
而檢廉追查的羅東土地都市計畫變更案，與「大羅東地區治水防災區段徵收案」有關，該地段在51年前被列為保護區而長年禁建，由於羅東鎮發展腹地受限，前代理縣長陳金德曾向行政院爭取在2018年解禁，將保護區改為農業區、住宅區及公共設施用地共12個單元，總開發面積近百公頃，經費至少需80億元，周邊土地開發利益龐大。
其中，位於羅東運動公園周邊的住宅區面積約1.3公頃，一度被變更為「機關用地六」，將由政府辦理徵收做為機關用地，由於土地價值受影響，引發相關地主反彈，林姿妙上任後，評估無論縣政府或鎮公所都無力動支超過6億元徵收「機六」土地，縣政府便將其變更回原來的住宅區，遭民代大肆抨擊，後來又改成機關用地，並計畫籌編預算辦理徵收。
不僅機六用地惹議，位於宜蘭五結路三段的單元十二居民日前也組成自救會，赴縣府拉白布條抗爭，住戶質疑當地是住宅用地，縣府卻以淹水為由，打算徵收、拆屋改建成停車場及蓄洪池，但旁邊的農地卻變成建地，居民想找林姿妙溝通不成，懷疑有人與建商掛勾。
由於機六主管土地變更權責為建設處代理處長吳朝琴，負責辦理羅東區段土地徵收的地政處長楊崇明也被列為被告交保，專案小組懷疑土地開發案疑雲重重，恐涉及圖利特定人士。至於羅東鎮公所晚會標案遭檢舉涉及貪汙，因金額不大，相關證據仍待查明。
對於代理處長吳朝琴被收押，宜蘭縣政府秘書長林茂盛說，他沒看到筆錄，不清楚案情，也不了解吳是否在偵訊中緊咬縣長；至於羅東土地區段徵收開發計畫，縣府依都市計畫委員會審議通過後才進行，且多次召開公聽會並和自救會溝通協調，一切依法行政，絕未涉及不法。
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