針對賴清德副總統4日表示，陳水扁政府2004年所提的軍購特別預算，在立法院遭到在野黨反對而無法通過，否則8艘潛艦早已成軍。國家政策研究基金會副研究員揭仲今天（10/05）指出，在野黨當時反對軍購特別預算，主因是民進黨政府形同要立法院在缺乏基礎資訊的情況下，一次同意4121億高額的潛艦預算，加上愛國者3型防空系統因為民進黨操作「公投綁大選」，在公民投票中遭到否決；至於陳水扁總統任內無法取得潛艦，除了因為美國內部在「911恐怖攻擊」後反對聲浪增加外，關鍵的原因是美國一直找不到願意合作的歐洲國家。
揭仲表示，首先，陳水扁政府2004年6月時所編的8艘潛艦預算，不僅金額高達4121億，又編在特別預算中，等於要立法院在型號與噸位等基本資料都一無所知的情況下，一次通過長達10多年的預算，形同給政府一本上限為4121億(後下修為2880億)的空白支票簿；且特別預算通過後，立法院在購案執行期間根本難以監督。第二個原因是民進黨政府為拉抬總統選情，不惜使出「公投綁大選」策略，導致愛國者三型飛彈系統在公投中遭否決，但民進黨政府仍然將其編入特別預算中，公然違反《公民投票法》。
揭仲說，由於在野黨反對，使民進黨政府最後被迫從善如流，先是將潛艦採購全部改用年度預算編列，讓立法院可逐年審查執行情形。更重要的是，國防部在2006年4月，也改採「兩階段造艦方案」，第一階段先編列約117億的「潛艦可行性評估」預算，完成潛艦的設計並確定構型，然後在獲得立法院同意後，接續編列第二階段的建造預算；而非要求立法院在型號與噸位都不清楚的情況下，一次通過10餘年的天價預算。在完成這些修改後，包含「潛艦可行性評估」預算在內的2007年國防預算就獲立法院通過。
揭仲提醒，2006年4月國防部提出的「兩階段造艦方案」，其實跟現在潛艦國造案的模式，即先進行「合約設計」，然後再進行「原型艦建造」，幾乎一樣。更值得注意的是，2015年馬英九政府定案的潛艦國造第一階段「合約設計」，為時4年卻僅需30億；而2006年民進黨政府的「潛艦可行性評估」預算，卻高達117億! 揭仲說這似乎可窺見，若2004年下半年立法院一次通過上限4121億的預算，說不定會有許多不精確、甚至浮濫的情形。
至於在野黨的反對是否使中華民國錯失早些取得8艘潛艦的機會？揭仲表示，預算無法通過固然使華府不滿，也讓華府後來要求對台軍售案必須等立法院通過預算後，才與我方簽署《發價書》，但並非是讓華府態度轉變，不再軍售8艘潛艦給我方的原因。最明顯的例證就是2006年4月3日，當我方國防部提出要求，請美國評估「兩階段造艦方案」的可行性時，時任美國國防部副助理部長的勞勒斯(Richard Lawless)，就曾以信函正式告知我方，「兩階段採購在法律上是可以的，且在行政上亦可行」，證明華府官方也贊成此一方案。
揭仲認為，導致華府態度轉變的原因，除美國內部在「911恐怖攻擊」後反對聲浪增加，關鍵是美國始終找不到合作的歐洲廠商。
揭仲解釋，當小布希總統2001年宣布出售8艘潛艦給我方時，由於美國官方的政策是不在美國本土建立傳統潛艦的生產線，因此就只能尋求歐洲的造船廠合作，由歐洲廠商提供藍圖並造好船段後，再運到美國安裝美製的戰鬥系統；但美國從2002年初到2007年底，花了整整6年、中間幾經轉折，卻還是找不到願意與美國合作的歐洲國家，包括美國原本認為希望濃厚的德國與西班牙。
揭仲指出，美國國防廠商從2002年初就和德國政府談判「輸出許可」，但到2003年9月都沒成功，於是放棄；等梅克爾2005年11月成為德國總理後，美國一度重燃希望，但還是無法扭轉德國政府的決定。至於西班牙則是在2004年3月的國會大選中，具反美傾向的社會勞工黨勝選，隨即宣佈自伊拉克撤軍，使美西合作為中華民國造潛艦的希望之窗也就此關閉。
