韓國漫畫振興院除了扶植韓國漫畫，也負責經營「韓國漫畫博物館」，將韓國漫畫的相關資料進行收集、保存及展示。韓國漫畫振興院博物館運營組長李勇哲表示，除了前兩年因疫情因素導致入館人數減少，其餘每年至少都有20萬人來參觀博物館。
成立於2001年的韓國漫畫博物館緊鄰韓國漫畫振興院，共有4層樓。李勇哲表示，每年韓國漫畫振興院會針對不同主題籌設4到5次的漫畫特展，例如目前正在展出以狗為主題的寵物特展，「韓國有5,000萬人，其中超過1,000萬人養寵物，我們希望藉由這樣的展覽表現人跟寵物之間的關係。」
不少參展的漫畫家在創作中述說與寵物間的故事，除了以漫畫為媒介，還以影像等多元形式展出；此外，展覽開幕的前兩週，韓國漫畫振興院還特別舉行「人與毛小孩一起看展」的活動，讓飼主與狗狗一起來參觀博物館。
韓國漫畫博物館也設有「韓國漫畫歷史」的常設展覽，完整描述從1909年到現代的韓國漫畫的發展軌跡，保存許多韓國的知名漫畫，並結合AR科技，讓參觀者可透過手機觀看導覽；另外也有近年全球蔚為風潮的「WEBTOON」展區，以平板螢幕呈現，除了有《與神同行》等早期經典作品，也定期展出近年火紅的WEBTOON漫畫。
另外，韓國漫畫博物館內也設置「韓國漫畫圖書館」，收錄26萬冊的韓國及海外漫畫，包括日漫《名偵探柯南》等作品也在其中，是韓國最大的專業漫畫圖書館。
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