現在全球面對Omicron變異株的威脅，疫情不斷攀升，連帶影響國內境外移入個案暴增，指揮中心統計截至今（14）日為止，境外移入染上Omicron變異株的有278例，其中遭到突破性感染的就有259例，比例高達93%，指揮中心發言人莊人祥表示，境外移入遭突破性感染的個案中，打三劑疫苗的人並不多，也有很多是剛打完第三劑但還沒滿14天就被感染。
莊人祥表示，雖然沒有計算遭到突破性感染的個案中，有多少人打過第三劑疫苗，但總體看下來，大部分的人都是打了兩劑疫苗而已，打三劑疫苗的人並不多。陳時中今（14）日在記者會上也表示，昨（13）日國際確診報出來的人數就有345萬人，強調這是一個非常高的數目，記者會最後也耳提面命「打疫苗，大家不要忘記打疫苗」因為Omicron變異株在先前南非的研究中有發現，Omicron存在大量的免疫逃脫，因此打了兩劑疫苗還是很可能遭到突破性感染。
目前指揮中心已經把第三劑間隔縮短為三個月，衛生福利部傳染病防治諮詢會預防接種組（ACIP）李秉穎也提到，新冠疫苗被發現抗體會逐漸下降，加上有變種病毒出現，因此追加劑就相當重要，尤其對於免疫功能不全的人來說，「第三劑可以算是他的基礎劑」，這樣一來才能用疫苗建立最基本的地基，維持一段時間的保護力。
