不活化疫苗（中港稱「滅活病毒疫苗」）含經化學處理的 SARS-CoV-2 顆粒，使其不能真的感染，這類疫苗穩定且相對容易製造，為中國全球疫苗外交的一部分廣泛分發，成為許多國家的首選疫苗，但大量實驗表明，不活化疫苗對 Omicron 幾乎沒有保護作用。
許多接種兩劑滅活病毒疫苗者，未能產生可以抵抗 Omicron 傳播的免疫分子，即使接種第三劑不活化疫苗，個體的「中和」抗體仍保持在較低水平，這種抗體可以有效防止病毒感染細胞，顯示第三劑注射另一種疫苗，例如 mRNA 或次單位疫苗，似乎更能預防 Omicron。
這些發現促使許多科學家和公共衛生研究人員，重新評估不活化疫苗對抗全球新冠肺炎疫情的作用。斯德哥爾摩卡羅林斯卡研究所的臨床免疫學家 Qiang Pan-Hammarström 表示，目前這個階段，人們必須改變想法，並調整疫苗接種策略。
不活化疫苗在去年全球疫苗運動發揮重要作用。據倫敦數據跟蹤公司 Airfinity 數據，包括中國科興和國藥集團生產的疫苗，迄今全球交付超過 110 億劑，印度 Covaxin、伊朗 COVIran Barekat 和哈薩克斯坦 QazVac 等不活化疫苗也交付超過 2 億劑。
不活化疫苗對預防住院和死亡仍至關重要，並可為尚未接種疫苗的個體提供有價值的免疫啓動功能，但去年 12 月出現不活化疫苗可能無法抵抗 Omicron 的早期跡象，當時香港研究人員分析 25 名接受兩劑 CoronaVac 疫苗接種者的血液，沒有一個人檢測到新變異株的中和抗體。
CoronaVac 疫苗由總部位於北京的科興生產，但科興對這發現提出異議，指出內部數據顯示，接種科興疫苗的 20 人，有 7 人抗體檢測出能中和 Omicron 的抗體，得出不活化疫苗對 Omicron 有一定效力結論，雖然不一定能免受 Omicron 感染，但仍能預防住院和死亡。
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