準閣揆陳建仁今天(29日)公布第三波內閣首長名單，外交部長吳釗燮、國防部長邱國正、陸委會主委邱太三皆留任。預定接任行政院發言人的內政部次長陳宗彥表示，這次國防外交與兩岸事務機關首長名單，是蔡英文總統與陳建仁院長進行充分討論，以持續落實加強全民國防、國安外交工作零距離、穩健兩岸政策為原則，讓國防外交與兩岸事務等工作，能夠穩健銜接並迅速就定位。
此波名單還包括，原海基會副董事長兼秘書長詹志宏將轉任陸委會副主委、原陸委會副主委邱垂正則將轉任海基會副董事長兼秘書長，而原先另一位陸委會副主委吳美紅，因具文官資格，故將轉任海委會常務副主委，其陸委會副主委遺缺將由前台北市議員梁文傑接任，海委會另一位副主委周美伍兼海巡署長留任。
