指揮中心認為，目前本土疫情是高峰期過後的高原期，因為28日比上週再上升3%，新增48421例當中，新北超過一萬例，不過，0+7邊境解封規劃如期上路，明天(9/29)就會公布，不過，開放同時，高風險群的保護力仍然要提高，除了10月1日，照往年開打流感疫苗，10月3日第二階段的對象，像是醫事人員、機組員等，都能接種次世代疫苗。
疫情指揮中心疫情監測組長周志浩：「比起上禮拜三，(本土)大概也是增加一點點，增加3.7%。」
連三天數字都往上走，28日本土48421例，新北超過一萬例，台中也有六千兩百多例。死亡38人中，有一位30多歲男子無慢性病史，沒有打疫苗，出現咳嗽、發燒、快篩陽性，但沒有通報看診，突然在家中意識不清，送醫檢查喉嚨痰多，懷疑呼吸道阻塞，急救無效，從快篩陽到送醫死亡僅短短五天。
疫情指揮中心指揮官王必勝：「判斷上應該是一個，高峰過後的一個高原期。」
也就是疫情還沒走下坡，眼看流感季將來襲，除了專家小組也同意，9月30日起青少年也可打Novavax。因此10月1日照往年開打，公費流感疫苗，次世代也在往下開，10月3日起第二階段的醫事機組人員，50到64歲成人等都開放，而且兩種疫苗能夠同步施打。
台大醫師李秉穎：「長者要打流感疫苗、新冠疫苗，還有肺炎鏈球菌疫苗，可能一手打一針，另外一手打兩針，可是那兩針的距離，我們都是建議，至少一英吋以上。」
高風險群保護力優先提升，畢竟29日即將公布，邊境解封0+7方案。
疫情指揮中心指揮官王必勝：「(確診者的)同行者目前，還是以繼續相關行程，用快篩取代隔離。」
一旦入境免隔離，指揮中心規劃防疫旅館，全數退場，入境旅客若在台確診，可以選加強版防疫旅館，或集中檢疫所隔離。不過台大公衛教授陳秀熙認為，照目前來看境外0+0，其實10月中就有條件。
疫情指揮中心指揮官王必勝：「實施後的效應，如果沒有太多問題，看是不是往0+0發展。」
分階段解禁，就怕一次全放，疫情再起難以負擔。
