中央流行疫情指揮中心去年4月將機組員的隔離檢疫措施從「5+9」調整為「3+11」，引發外界質疑是後續爆發本土疫情三級警戒的破口。對此，監察院22日發布調查報告，認為決策考量雖有所本，但衛福部未善盡對外詳細說明之責。結果遭國民黨砲轟，質疑「3+11」對台灣傷害這麼大，監察院卻連糾正都不敢，一味護航當時的防疫指揮官、現在的民進黨台北市長參選人陳時中，乾脆關門算了！
對此，疫情指揮中心發言人莊人祥今天(23日)重申決策的依據，強調在2020年底之前，機組員的檢疫規定原本就是「3+11」，後來因為秋冬專案才改為「7天居家檢疫+7天自主健康管理」。於此階段，指揮中心也同時觀察航空公司是否能落實外站零接觸，並確保航空公司能落實管理之責。因此等到整個秋冬專案告一段落後，發現整個外站管理進步很大，包括加裝監視器並使用一次性房卡，機組員違規狀況也大幅降低，因此才鬆綁為：5天居家檢疫，採檢陰性也可進行9天自主健康管理，之後再由民航局修正相關規定，同時加重航空公司的管理責任，並祭出相關處分。
莊人祥指出，隨後指揮中心於4月13日再次檢視管理成效，發現整個違規件數幾乎是0，並且從3月4日到12日，總計採檢了9千多人，也都是陰性，因此才決定進一步放寬3天的居家檢疫後採檢，再進行11天的自主健康管理。
