馬偕學校財團法人、真理大學財團法人同屬基督教長老教會，3月6日舉行北部台灣基督長老教會大會時，表決通過兩校合併議題。教育部證實，去年底就有接獲北部台灣基督長老教會洽詢過相關法規，但至今尚未接到合併計畫書或意向書。
教育部表示，「法人合併」和「學校合併」是屬於不同的類型，馬偕學校財團法人包括馬偕醫學院和馬偕醫護管理專科學校等兩校，真理大學僅只有一校。
真理大學則指出，長老教會大會初步決議將由1個董事會管理真理大學、馬偕醫學院與馬偕護校等3校，預計在3月底再開會，決定21席次董事名單。
教育部指出，若「一法人多學校」不會影響三校各自辦學，包括學制、教師聘任、學生安排，但若法人合併後要推對併校的話，就要依照《大學法》、《私立學校法》來辦理，私校須經董事會同意，並報由教育部核定。
近年法人合併再併校的例子有前跡可循，例如宏仁女中與立仁高中。不過，教育部長潘文忠曾說現階段目標不是讓大學併校，而是讓辦學堪憂的私校直接退場。
