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國安會今（28）日遭爆逾權干涉建軍事務、插手統帥權，讓國安會與國防部之間關係備受外界關注，對此，國防部稍早回應澄清，強調國安會與國防部是一個團隊，為了國家安全共同努力。總統府發言人張惇涵出面滅火，表示該報導未向總統府查證，內容夾敘夾議，與事實不符。
國防部回應指出，該報導說法無端，與事實不符，國防部解釋，依我國國防體制，總統統率全國陸海空軍，為三軍統帥，行使統帥權指揮軍隊，直接責成國防部長，由部長命令參謀總長指揮執行。總統為決定國家安全有關之國防大政方針，或為因應國防重大緊急情勢，得召開國家安全會議。
國防部表示，國安會與國防部，皆為國安團隊重要一份子，「一個團隊、一個目標」，皆以提升國防戰力、強化國家安全為目標共同努力。報導所謂「插手統帥權」說法無端，並非事實。國防部最後呼籲相關媒體，於進行報導前，應善盡查證之責，謹守社會公器分寸，避免影響大眾視聽。
總統府發言人張惇涵也強調，國安會依照總統授權及指示，協助總統處理各項國安業務，不可能逾越權力、插手統帥權。張惇涵指出，此值國際政經局勢複雜變遷之際，國軍軍心、士氣尤為重要，該媒體連續兩天操作類似議題，可以休矣。
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