近年離岸風場急速發展，影響水下生態問題亦備受關注。國立台灣海洋大學系統工程暨造船學系團隊的長期研究顯示，離岸風場建設，尤其是在打樁過程中產生的高強度噪音，令風場週遭石首魚科魚種減少「大合唱」。研究結果刊登於知名國際期刊《海洋污染公報》（Marine Pollution Bulletin）。這也是台灣首個在離岸風場進行的被動聲學長期研究。魚類專家邵廣昭則認為，魚類減少原因眾多，需累積營運後幾年的較長期資料，或是和對照組資料比較才能證明。
海洋風電2019年商轉 海大團隊佈聲學監測站
台灣首座離岸風力發電廠、位於苗栗外海的海洋風電由22台渦輪機組成，發電量高達128MW。首兩台風機在2016至2017年間商轉，其餘20台風機則於2019年開始商轉。
海大系統工程暨造船學系助理教授Shashidhar Siddagangaiah的研究團隊，自2014至2019年間，在海洋風電風場邊界設被動聲學監測站，團隊將錄音機安置在海底18～20米深處，距離風機200公尺到5公里不等、距離苗栗龍鳳漁港約5公里。錄音機採樣頻率為48和96kHz，錄製時間為1小時；每年進行監測兩至三次，每次天數會受天氣條件、記錄器可用性、船隻與人力等因素影響，每年總監測天數從109到226天不等。
研究發現，苗栗500～2500Hz頻率範圍的水下聲景，受兩種「大合唱」強烈影響，推測為石首魚科的兩個物種，其中一種編號為「類型2」（Type 2）的物種是姑魚（學名：Johnius taiwanensis），另一種編號「類型1」（Type 1）的物種則未被辨識。
研究發現：石首魚科大合唱並沒有持續整個夏天
研究團隊說明，發聲魚類在魚群行為、領地防禦、覓食和產卵期間，會以合唱方式維持社群凝聚力，而不少魚類依靠聲音進行交流及維持生存功能。而除了天然因素（比如月相、潮汐、季節…等），過往已有研究指出，人為活動造成的水下噪音增加，或影響魚類發聲、游泳速度、社群凝聚力與方向改變，甚至會令聽力與組織受損，嚴重恐造成死亡。
2014到2018年間，研究團隊曾在距離本次監測站90公里遠的彰化進行另一個水下聲景研究，該水域當時尚未興建離岸風場，在沒有明顯人為干擾的自然氣候和天氣因素下，該次研究記錄到類型1及類型2兩個物種，通常會在3～4月逐漸發出第一批聲音；6～8月則會表現出一致合唱，合唱的強度與持續時間也將達高峰，持續時間約從晚上6時至清晨5時；隨後歌聲會慢慢減少，至10月底左右結束；12～2月則不會合唱。
然而，這次苗栗海洋風場邊界的水下聲景研究則發現，即使在同一季節，不同年份的合唱模式也不一致。2014年5～6月及2015年7～10月，研究團隊觀察到晚上6時至清晨5時，會有一致的合唱，但2016年至2018年有連續幾天的凌晨零時至清晨5時，則沒有記錄到合唱。此外，本來預計合唱會在3月上旬出現並持續整個夏季，但2019年3月至8月初並沒有相關合唱模式，一直等到8月中旬才開始出現。
團隊進一步分析類型1（未知物種）和類型2（姑魚）的合唱時間與強度，發現2014年姑魚在89%監察天數中有合唱，但至2019年則大幅下降至只剩22%；強度與持續時間亦下降。未知物種的合唱比率亦有減少，從2014年監察天數中的98%，下降至2019年的82%；合唱的峰值聲功率譜密度（PSD）也從112dB下降了15dB，持續時間亦從5個多小時，顯著縮短了3個多小時。
研究團隊強調，不可忽視風場開發過程產生的噪音，並呼籲發展離岸風電須更加謹慎規劃，以減少噪音對生態系統的負面影響。不過團隊亦強調，本次研究並未考慮風場引起的其他海洋變化。
魚類專家邵廣昭︰風機對魚類不一定有負面影響 岩礁棲性魚類逐漸增加
沒有參與此份研究的魚類專家、中央研究院生物多樣性研究中心榮譽及兼任研究員邵廣昭則稱，風場建設對魚類影響最大是施工時打樁的噪音震動，會把附近魚類驅離，也會影響發聲魚種的行為，且魚類發聲目的是否為了繁殖和產卵，目前尚有爭議。
但他亦強調魚類減少的原因眾多，過度捕撈仍是主因。
過去十年，邵廣昭在台灣海峽研究魚類資料發現，大多數石首魚的繁殖期很長，甚至橫跨兩季，產卵地點範圍亦可橫跨三至六個縣市，故很難用管制施工時間或地點作為減輕措施。至於成魚的長期監測資料，目前已知施工期的沙泥底棲性或中表層洄游性魚類數量可能會減少，「但施工完畢後，應該會再回來」。邵廣昭強調，這需要累積營運後幾年的資料或是和對照組資料比較作證明。
邵廣昭稱，離岸風機真正在打椿的時間並不長，也還未曾發現魚類大量死亡現象，認為造成的影響應有限亦很難量化。風機開始營運後的20年期間，營運噪音的影響很小，目前還未看到國外野外現場實地研究有相關負面報導。另一方面他也認為，風場內原本沒有岩礁棲性魚類，但因風機具有人工魚礁及海洋保護區的效應，岩礁棲性魚種和數量也在逐漸增加。