執掌違法、失職公務員懲戒的公務員懲戒委員會，與最高法院、最高行政法院並稱「三終審」，但功能常被外界誤解，甚至低估。立法院今三讀通過公務員懲戒法、懲戒法院組織法修正案，公懲會正名為「懲戒法院」，懲戒程序將由一級一審制改為一級二審制。
本次修法有6大重點，除改制懲戒法院、一級二審制度外，還包括強化懲戒實效、公開審理、兼顧公務員權利保障、修正再審程序。改採一級二審制後，為避免公務員藉資遣或退休、退伍規避懲戒，修法也調整禁止公務員資遣或申請退休、退伍的時點，明定自送請監察院審查或移送懲戒時起至懲戒處分生效時止，受懲戒的公務員都禁止資遣或申請退休、退伍，防堵搶退。
司法院秘書長林輝煌表示，本次修正依司法院釋字第396號、第583號解釋意旨，使公懲會分庭審判、行言詞辯論、兩造對審、引進辯護制度、給予被付懲戒人最後陳述的機會，並且增加懲戒處分種類，建立層級化的懲戒處分行使期間，以提升審理效能、健全懲戒實效。
公懲會原以審議會方式審議公務員懲戒案件，將來改採法院體制，懲戒案結果也以裁判方式作成；另為因應法官法中職務法庭制度變革，因此去年6月28日修正公懲會職掌和組織變更。但因懲戒新制施行以來，外界對「公務員懲戒委員會是否為法院？」有誤解，司法院為求名實一致，將公懲會正名。
現行公務員懲戒為一級一審制，被付懲戒人無從上訴，但憲法第16條保障人民訴訟權，釋字第752號解釋也有相關解釋，以賦予當事人在不服懲戒法院初次判決時提起救濟的權利，以發揮糾錯及權利保護功能，因此公務員懲戒法修正草案將公務員懲戒程序改為一級二審制。
懲戒法院分「懲戒法庭」與「職務法庭」，但兩者成員組成來源、任命程序、掌理審判事務類型等都不相同，未來分別由懲戒法庭、職務法庭法官組成的法官會議各自議決年度事務分配、代理次序、法官配置等，不彼此侵越權限。
修法後，公懲會委員長將改為懲戒法院院長，公懲委員修正為「法官」。懲戒法庭第一審案件的審理和裁判，以法官3人合議，並由資深法官充審判長；第二審案件以法官5人合議，由院長充審判長。而職務法庭第一審懲戒案件則由職務法庭法官和「參審員」評議。
