日本福岡及熊本的牧場近日出現牛結節疹陽性案例，防檢局本宣佈，鮮乳、鮮奶油暫停輸台，但一日後政策急轉，經巴氏殺菌的乳品，檢附相關證明可來台，日本肉品可持續進口。然而，金門於8月出現牛結節疹案例，金門生鮮、冷藏、冷凍牛肉至今仍暫停輸台，遭外界質疑「厚此薄彼」。
防檢署強調，乳、肉品輸入都依 WOAH 的國際規範，台灣肉牛產業發展協會理事長張志名批評，金門、日本都出現牛結節疹，卻受到不同待遇。台大動物科學系教授徐濟泰直言，過往台灣防疫非洲豬瘟時，嚴格把關邊境，連熟肉都不可入境，防檢署對金門防範嚴密，卻未對進口牛肉比照辦理。
日本牛肉不受限、金門牛肉仍暫停輸台
牛結節疹為台灣法定甲類動物傳染病，日本官方11月6日公告牧場出現牛結節疹，但我國准許日本牛肉來台。然而，2020 年 7 月、今 (2024) 年 8 月，金門出現牛結節疹案例，為了防疫，農業部暫停金門牛肉來台。
為何日本牛肉不受限？防檢署署長邱垂章說明，人所吃的牛肉為牛的骨骼肌，依 WOAH 規定，骨骼肌為牛結節疹安全貿易商品，因此日本牛肉不會受限，且所有進口牛肉來源國都適用，日本並非特例。
邱垂章表示，之所以要限制金門牛肉，是因為防檢署前往金門縣，發現到牛結節疹確診牧場中，牛隻並未完全施打牛結節疹疫苗，也未施打口蹄疫苗，儘管台灣、澎湖都已重返口蹄疫非疫區，但金門仍是口蹄疫的疫區，且金門和中國距離相近，金門許多肉牛是半放牧的，因此防檢署才會採最高規格的防疫措施，並暫停金門牛肉輸台，不僅是考量牛結節疹，降低口蹄疫傳播風險。
台大動物科學系教授徐濟泰對防檢署做法並不認同，他直言，過往台灣防疫非洲豬瘟時，嚴格把關邊境，連熟肉都不可入境，防檢署對金門防範嚴密，卻未對進口牛肉比照辦理。
中興大學獸醫系教授莊士德則認為，防檢署做法可接受，因為金門和日本的飼養狀況不同，金門肉牛要完全落實施打疫苗並不容易，但日本原非牛結節疹疫區，此次陽性案例零星，嚴密監控便可避免疫情擴散。
肉牛產業協會：防檢署厚此薄彼
對於防檢署說法，張志名認為，「邏輯不通」，農業部暫停金門牛肉輸台的原因都是「牛結節疹」，先前並未提到任何口蹄疫疫苗施打問題，若牛肉是牛結節疹安全貿易商品，禁止金門牛肉輸台毫無說服力，而同樣是牛結節疹確陽性，防檢署對金門牛肉說擋就擋，但對日本牛奶卻是說開就開，日本牛肉則毫無限制，「根本是厚此薄彼」。
張志名表示，防檢署針對牛結節疹確診地區的乳、肉品輸入檢疫規範、防疫對策，說變就變，真實原因究竟是防疫考量，抑或是經貿需求、有無專家會議討論，都應清楚向國人交代，而對比台灣防範非洲豬瘟，邊境嚴防任何熟肉入境，現階段對日本牛肉、牛奶的防疫強度非常低，除了放行，防檢署應提出對應配套、保障台灣乳牛、肉牛產業。
張志名也直言，若金門是因為防範口蹄疫而牛肉暫停輸台，但金門也有努力防疫、優秀的肉牛牧場，不應一竿子打翻一船人，防檢署應負責任地告訴金門，「安全的標準究竟是什麼？」例如：100%施打口蹄疫疫苗、蟲媒監測結果等。
金門肉牛過半銷到台灣本島，農民命脈中斷
金門以高粱酒和牛肉乾聞名，金門酒廠更是金門的經濟命脈，製酒產出的酒糟需要消化，金門肉牛產業便因此蓬勃發展。
金門縣青年牧場飼養 250 頭肉牛，青年牧場經營人陳玉嘉是金門縣第二屆青農聯誼會會長，他表示，金門牛肉的內需市場並不大，每年需求量不到 500 頭肉牛，十多年前金門牛肉獲准輸台後，每年銷台數量約 500 至 600 頭肉牛。換言之，台灣是金門肉牛重要的去路。
2020 年金門出現牛結節疹確診案例後，青年牧場是第一家施打疫苗的牧場。陳玉嘉回憶，出現牛結節疹前，金門肉牛在養頭數約 6500 頭，牛結節疹出現後，金門牛肉暫停輸台，停售時間超過一年，金門肉牛只剩縣內市場，但因牛結節疹對金門來說是新的疾病，縣內的牛肉買氣也下滑，「那時候縣內牛價掉得很快，可以說是崩盤」，如今縣內肉牛在養頭數只剩 4000 多頭。
陳玉嘉坦言，暫停輸台兩、三個月，影響不大，但時間拉長，「大家都受不了」，儘管可以藉由拉長飼養時間、延後上市，但牛是大動物，吃得越多、成本也越高，若延後半年、一年、兩年，牛會變老，品質、價格都不好。
牛結節疹疫情嚴重打擊了在地農戶的信心，畜牧業種種設備動輒百萬、千萬起跳，每頭肉牛要養 2 至 3 年才能上市，疫情出現、暫停輸台便讓所有心血泡湯、生路中斷，許多農民開始擔憂產業前景，有的開始減養、退場。
今年 8 月底，金門再度出現牛結節疹案例，金門牛肉再度暫停銷台。陳玉嘉表示，他主銷金門縣內市場，暫時沒有受到直接影響，但銷台禁令至今未解，原本銷台的肉牛牧場已經開始降價出售肉牛，回頭衝擊整體肉牛市場，「產業再度陷入惡性循環」。
金門飼養落差大，零星放牧者，防疫勞心勞力
相隔四年，金門再度出現牛結節疹確診案例，原因和中國有關。金門縣動植物防疫所所長林政道表示，金門與中國距離近，但中國疫情相對不透明，今年夏天中國傳出牛結節疹確診案例，而牛結節疹的傳播是透過蟲媒，因此造成今年金門的疫情。
出現牛結節疹確診案例後，金門動植物防疫所針對牧場進行消毒、蟲媒監控。林政道表示，上個月蟲媒調查已幾乎驗不出病毒的跡象。防檢署對金門、日本的肉品規範不同，林政道坦言，他不知道中央的決議過程，但也尊重防檢署的決定。
金門肉牛的飼養狀況差異極大，林政道分析，金門肉牛有數百頭的大型牧場，也有數十頭、零星幾頭小規模飼養，大型牧場的防疫措施通常都做得很好，會定期找防疫所來打疫苗，牧場內牛隻集中、有設備協助，打疫苗速度極快，但小規模、零星飼養的牧場，通常是半放牧狀態，必須一隻一隻趕到空地施打，防疫所則要耗費較多人力、時間防疫。
林政道直言，中央目前給予金門的疫苗、消毒劑等物資及人力都相當足夠，不過理想狀態下，金門的飼養技術若能提升、環境改善，肉牛牧場有一定經濟規模，更新牧場設備，並按時消毒、定期打疫苗，且要記錄牧場內的所有防疫動作，更能確保生物安全，目前部分金門牧場正在慢慢改革。
金門縣農會籲：應趁此機會幫助金門畜牧業轉型
金門縣農會總幹事文水成認為，為了去化酒糟，金門不可能不養牛，但防檢署對金門、日本的管制卻不同，相當沒有說服力，在產業來看，防檢署對日本、金門明顯「大小眼」，他認同防疫如作戰，但現階段，金門的飼養方式多與過往無異，金門和中國的距離無法改變，「也不是我們願意的」，除了撲殺、消毒、打疫苗，農業部應有更積極、整合性的對策，否則根本防不勝防。
陳玉嘉表示，肉牛是農民的身家財產，牧場比任何人都擔心疫情，也可以理解防疫做法，但若是為了防疫，防檢署暫停金門牛肉輸台，也應對日本比照辦理。
而金門本島多數肉牛牧場都願意配合政策、做好防疫，違規的農戶是少數，農政單位可以趁此機會輔導，違規者退場或是轉型，並規範輸台標準、資格，例如：牧場必須有疫苗施打紀錄，若不放心可再抽血檢測，檢測結果沒問題才可銷台，「不要每次都封殺我們」。
文水成指出，非洲豬瘟防疫政策最為嚴密，鼓勵零星小牧場離牧，讓飼養豬隻頭數集中於大牧場、以利管理，建議中央可針對金門的肉牛牧場型態做分級盤點，例如：49頭以下為小規模、50至99頭為中規模、100頭以上為大規模，各個規模的飼養型態、可能風險有哪些，並提供牧場離牧或是補助改建，讓牧場加強圍籬、改善牛舍走道等，「以此危機作為改變的起點，才是真的對金門好。」