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秋行軍蟲遍佈全台，目前僅剩4縣市未淪陷（基隆市、新竹市、南投縣、嘉義市）。農委會防檢局17日舉出3個例子判斷，目前已進入防治的「第二階段」，想要百分之百根除「幾乎不可能了」，未來需要面對的課題是「如何與蟲共處」；不過，防檢局說明，先前公布的「通報確認1萬元獎勵金」仍會繼續實施到21日，希望農民、民眾能繼續通報。
防檢局17日召開疫情處理記者會，並在同日召開第2次專家會議。防檢局指出，以秋行軍蟲的生命週期來看，台灣本島應該「已有第二代成蟲」，已經在台灣立足，就算想要極力消滅，也會付出極大的代價。
防檢局局長馮海東表示，未來最大的課題是「如何與蟲共處」。他說明，防檢局會成立相關計畫，蒐集更多秋行軍蟲在台灣的田間資料，以此調整因應策略，「我們要籌備如何與蟲共處，因為它已在此立足，如果要銷滅它要花掉的成本非常高，所以要設法降低它危害的影響。」
防檢局舉出3項台灣本島出現秋行軍蟲成蟲的例證判斷，想完全根除蟲害已是不可能，需要做好「共存」的準備。此3項例證分別是：
一、6／8苗栗首例發現4齡幼蟲，推估成蟲約6／18～6／20出現；6／10宜蘭頭城發現6齡幼蟲，推估成蟲約6／18～6／20出現。
二、6／13台東鹿野玉米田區發現「疑似卵塊1個」；6／13嘉義六腳銷燬田區發現「疑似蟲蛹1個」。
三、6／15嘉義東石銷燬田區發現「疑似雄成蟲1隻」；6／16花蓮壽豐、新竹關西銷燬田區發現「疑似雄成蟲4隻」；6／17苗栗通宵、屏東車城銷燬田區發現「疑似雄成蟲15隻」。
馮海東提到，經過討論後，防檢局決定從18日起進行強制噴藥的作業。他解釋，第一階段與第二階段不同處在於「移動管制」，流程分別是：
一、第一階段時，移動管制流程是：發現後進行「現地焚化銷燬」、「現地掩埋銷燬」，再進行費洛蒙誘集器的懸掛，最後才向防檢局申請解管制。
二、第二階段時，移動管制流程則為：發現後進行「強制噴藥」，再進行費洛蒙誘集器的懸掛，最後才向防檢局申請解管制。
農委會副主委陳駿季說明，從通報獎勵辦法實施起，到17日下午2點，全台共接獲3472起通報案例，其中幼蟲案場共有68件，目前已銷毀44個案場。他提到，台灣有21出誘捕到秋行軍蟲成蟲共34隻，其中離島地區誘捕到11例共21隻。
對於秋行軍蟲在台灣「遍地開花」的疫情，防疫人員表示，以「植物病蟲害流行病學」來判斷，秋行軍蟲早就在台本土化，否則不可能出現「一夕之間，各地都有」的情況。對此，彰化縣農務課課長蘇啟懷則強調，防治蟲害才是第一要務，外界不應妄加揣測。
除了原先出現的案例外，高雄市彌陀區17日也確認出現秋行軍蟲的疫情。對此，高雄市長韓國瑜17日晚間召開緊急應變會議，對防治工作進行分工協調，並請求中央盡速研擬IPM。
IPM是「有害生物綜合防治」，指在有害生物防治上，不僅使用單一方法，而是對各種不同策略進行條配運用，來控制有害生物的族群量低於不致造成重大經濟損失的閥值。執行IPM時，必須對當地生態的運作有充分認知，並謹慎計畫、追蹤對農業的影響。
