中國武漢肺炎疫情升溫，台灣確診病例截止26日晚間八點最新統計共有四例，然而，長榮26日緊急召開會議時宣布，27日起取消飛往中國航班，華航則是自2月1日起至10日共30個來回大陸的航班，國內主要2家航空公司，新春期間率先取消36個航班，因消息太過突然，讓旅客、旅行社都有些因應不及。
這次台灣航班臨時宣布取消航班飛往中國，首當其衝是長榮27由松山飛往杭州的班機，取消來回2班，此外，華航也宣布取消自2月1日起至10日共30個來回大陸的航班，包含桃園到瀋陽、西安、上海等，加上長榮航空共取消6個航班，換句話說國內主要2家航空公司，新春期間取消共36個航班。
長榮指出，目前航班取消第一階段措施，等農曆春節開工後，若武漢肺炎疫情難以控制的話，將有可能有更多航班宣布取消，航空公司現階段隨時密切關心疫情變化，也同時呼籲農曆年後要往返大陸台商、商務人士，留意航空公司官網上即時資訊。
長榮航空除取消松山飛往杭州來回航班外，也同時宣布大年初五(29)日由高雄飛往杭州來回、30日桃園飛往內蒙呼和浩特來回，總計6個航班；華航目前則決議是自2月1日起開始，共取消15個來回、30個航班。
華航公布取消2月1日到10日的30個航班，官網上也公布部分中國航班改退票作業辦法，適用對象為持有24日（含）前已開立的華航、華信機票，且已訂妥華航/華信航班及行程涉及港陸者，3月31日前都可申請。
至於原定農曆春節後返回中國工作台商，若遇上武漢疫情班機取消，華航表示，機票在有效期限內，可以更改搭乘日期，且當次豁免收價差、稅差及改票手續費，或者向航空公司申請機票退費，可豁免退票手續費，相關優選座位及預購超額行李亦可全額退費。
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