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武漢肺炎疫情嚴峻，大型集會活動感染風險大，疾管署也公布修訂的「集會指引」，提醒超過千人集會的活動舉辦前應先評估6大風險指標，包括參加者之間的距離、通風狀況，以及是否能落實手部衛生清潔等措施。
新公布武漢肺炎「公眾集會」因應指引指出，近期國內陸續確診家庭、醫院群聚感染病例，本土病例數已超過境外移入病例數且有感染源不明個案，皆為社區傳播的警訊。
根據世界衛生組織（WHO）定義，只要聚集人數在1000人以上就屬於聚眾集會，另外，像是開學、畢業典禮、節慶、祭典、運動賽事、宗教、政治性質等多人聚眾活動等也在適用範圍。
該指引指出，主辦單位舉辦公眾集會前應依6指標進行風險評估：
一、事先掌握參加者資訊風險較低：
指引指出，如掌握所有參加者之流行地區旅遊史、確診病例接觸史，進入活動前亦能進行症狀評估及體溫量測，則相對風險較低。反之，如無法掌握上述資訊，則相對風險較高。
二、室外風險較低、通風不良的密閉空間風險最高：
室外活動風險較低；通風換氣良好或可開窗通風的室內空間風險其次；至於通風換氣不良的密閉，室內空間則風險最高。
三、參加者距離至少保持1公尺：
指引中指出，活動參加者之間的距離：活動期間彼此能保持至少1公尺距離，風險較低。原則上距離越近，風險越高。
四、參加者位置固定風險較低、不固定風險較高：
活動期間參加者為固定位置或不固定位置：前者風險較低，後者風險較高。
五、活動持續時間越長，風險越高
六、活動期間落實手部衛生及配戴口罩：
可落實者風險較低、不能落實者風險較高。
指引中提醒，若公眾聚會經評估具有較高風險，建議應延期或取消，或改以其他方式辦理，當指揮中心宣布疫情已進入社區傳播階段，則應依指揮中心指示辦理，對於有慢性肺病（含氣喘）、心血管疾病、腎臟、肝臟、神經、血液或代謝疾病者（含糖尿病）、血紅素病變、免疫不全需長期治療者、孕婦等則建議避免參加。
一旦經評估決定辦理，主辦單位應定防疫應變計畫，包括事先對集會活動場所、用具消毒，設置充足洗手設施，1天以上、需安排住宿的活動應確保通風良好，避免安排多人集中在同一房間。
該指引表示，目前不建議所有參加者與工作人員全面配戴口罩，但若有工作人員可能經常直接面對面接觸出現呼吸道症狀患者，或是其他須在人潮眾多的密閉場所工作人員，則建議配戴口罩。
若發現疑似個案應立即依照應變機制通報衛生單位，並連繫後送醫院，將疑似個案送醫，同時配合衛生單位進行疫情調查與相關防治措施，並考慮是否調整、延期或取消，避免疫情擴大。
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