雖說中央流行疫情指揮中心已經將日本、韓國的武漢肺炎疫情警示提升至二級，但對於目前已經在日、韓當地旅遊，或是堅持要在此時赴日、韓旅遊的國人來說，究竟回國時，是否需要強制隔離、自主隔離、居家隔離，或是居家檢疫、自主健康管理？
以目前來看，國內僅針對曾有疫情警示三級以上地區旅遊史以及曾與確診病例接觸過的國人，要求進行強制隔離、自主隔離、居家隔離，或是居家檢疫、自主健康管理等措施，換句話說，目前僅針對有中國大陸、香港、澳門旅遊史，以及曾與確診病例接觸過的人士，必須接受且進行相關檢疫措施。因此，如果目前人在日本、韓國旅遊或出差，回國後，暫時不需要進行相關檢疫措施。
然而，因應兩國疫情進展快速，指揮中心也已會同健保署，將在由日韓兩國返國民眾的健保卡中，加註有日韓旅遊史的資料，主要是希望在萬一民眾在回國後，發生身體不適的狀況時，能夠循線進行疫調，找到相關的接觸史。
不過，今（22）日上午中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中，在回答記者提問時也表示，提升日韓兩國旅遊疫情警示是依照該國疫情進展所做的決定，未來也不排除視疫情進展狀況，針對兩國進行邊境管制。
換言之，若後續指揮中心進一步針對日韓等國，提升旅遊疫情警示，則後續赴日韓旅遊、出差的國人，回國後可能就必須要進行自主健康管理或居家檢疫了。