台北市長柯文哲上屆任內曾誇下海口，要悠遊卡公司獲利翻倍，結果獲利並未增加，反而獲利腰斬，就連市占率也節節敗退。台北市議員全面健檢悠遊卡發現三大病症，悠遊卡公司任內稅後淨利減少1.1億，幾乎腰斬；悠遊卡市占率年年下滑，傳統優勢不再；推行電子支付不但落後競爭對手，Line Pay一卡通市占率還躍升龍頭。
台北市議員陳炳甫表示，悠遊卡公司政策方向錯誤，除了讓一卡通進入台北市，悠遊卡卻無法對等的進入高雄市。前董事長林向愷在任內看錯未來趨勢，花300萬委託以色列公司準備發展自己的支付方式，後續全面更新讀卡機更要花2億元。
另外，現在各家票證公司都在開拓電子支付，一卡通最早在去(2018)年8月就申請核准通過電子支付，今(2019)年3月Line Pay一卡通市占率已經來到28%，而玉山銀行19%，街口支付、歐付寶各占16%。
台北市議員徐弘庭痛批，除了使用範圍不對等的開放外，悠遊卡公司還曾意氣用事向金管會嗆聲，讓原本優勢不再，未來還可能面臨北捷閘門的感應速度的問題，悠遊卡在電子票證市場上遠不及其他機構。
台北市議員王鴻薇質疑，悠遊卡公司成立電子支付推動小組，每兩個禮拜開一次會，議員要電子支付資料卻說恕難提供，悶著頭在做市占率已經下滑，稅後淨利從柯文哲上任的2.6億至去年結算只剩下1.4億。
關於悠遊卡公司的營業額及市占率不及一卡通，台北市長柯文哲指出，悠遊卡對台北市府來說是政策工具，也有行政優勢，其實悠遊卡公司的目的也不單完全是為了獲利。再者，既然已經開放市場，悠遊卡市占率本來就不可能像以前獨占市場一樣，至於電子支付，希望議會能再給市府半年的時間，6個月保證可殲滅敵軍。
