新冠肺炎（COVID-19，武漢肺炎）在台疫情不斷延燒，108國中硬式聯賽為雖如期開打，但為了防疫需求不開放觀眾入場，不過這2天仍有不少觀眾在棒球場外圍群聚甚至進入球場，為保護球員健康的防疫規定猶如虛設。
為了防止疫情擴大，學聯對於今年的賽事原有延後或取消的打算，不過為了學生升學權益，決定如期舉辦，雖也很希望各界能多關注學生賽事，不過與防疫大事相較之下，只能決定閉門開打，避免成為台灣疫情破口，也能大大保護參賽球員的健康。
賽事進行期間學聯以高規格防疫標準因應，每支球隊每天進入球場每個人都必須如實登記及測量體溫，且每個球場都備有額溫槍及消毒酒精，每個場地也都有護理師待命，球員若要進入密閉空間治療或冰敷，一律得配戴口罩。
就連裁判、監場老師及相關工作人員每天到場也都必須詳實登記及紀錄額溫，待在室內也都必須戴著口罩，賽前兩隊也取消列隊及握手，僅由雙方教練致意，且也保持一定距離，目的就是希望能讓球員在健康的環境比賽，不要因疫情受到影響。不少家長曾反應，希望聯盟有限度開放進場觀賞孩子比賽，但在考量無法百分百掌握、控管進場人員的狀況，學聯只能婉拒這項要求。
這次賽事開打，竹縣峨眉在疫情考量下直接棄賽，不開放觀眾進場的狀況下，登記為球隊領隊的新北二重國中校長鍾兆晉就在二重比賽時直播讓想關心賽況球迷能關注比賽。
不過預賽開打的這2天仍有不少人士以各種名目接近甚至進入球場，不但成為控管漏洞也增加群聚感染的機會。學聯呼籲，希望大家能遵守防疫規定，一起維護球員健康比賽的權力及環境，別讓小球員暴露在高染疫的風險當中。
