雖然國內腸病毒疫情已經脫離流行期，但是還有零星病例通報，根據疾管署表示，最新新增2例腸病毒併發重症病例，其中包含1例死亡，且發病到死亡僅有短短18天的時間。
死亡個案是一名出生僅3天大的女嬰，在去(2019)年12月下旬發病，因陸續出現呼吸中止、發燒、活動力差、急性呼吸窘迫症、血小板下降、多重性器官衰竭及瀰漫性血管內凝血不全症等症狀，檢驗審查確認為伊科病毒6型併發重症，個案在新生兒加護病房住院治療，最後仍然不幸後過世，過世時僅出生滿三週。
疾管署防疫醫師林詠青表示，這名女嬰遭傳染腸病毒可能的原因有三個，其中有可能是媽媽產前就有感染腸病毒，透過胎盤傳染，也可能是媽媽、親友的接觸傳染，亦或是嬰兒室的相互傳染，但當時嬰兒室並沒有群聚感染的狀況。
林詠青強調，只要產婦生產前有感冒症狀，一定要告知醫師，看嬰兒時也要洗手，有感冒、拉肚子症狀時，都要避免接觸新生兒，甚至不鼓勵母嬰同室。而伊科病毒6型併發重症，從2007年至今僅有4例，其中3例都是新生兒，而且兩個死亡。
另1名重症個案為北部1歲女童，這名女童在1月5日到1月6日出現發燒、嘔吐、肌躍型抽搐及四肢紅疹等症狀，二度就醫後收治住院並通報，經驗審查確認為腸病毒71型併發重症，目前個案狀況穩定，已經出院返家。
疾管署提醒，家長或嬰幼兒照顧者不可輕忽腸病毒威脅，應落實個人與嬰幼兒手部衛生，一旦發現嬰幼兒出現嗜睡、意識不清、活力不佳、手腳無力、肌抽躍(無故驚嚇或突然間全身肌肉收縮)、持續嘔吐與呼吸急促或心跳加快等重症前兆病徵，應儘速送醫以掌握治療黃金時間。
