2018年北農春節休市風波造成菜價下跌，使時任總經理吳音寧備受外界抨擊。監察院13日公布調查報告，指北農未於事前協調減少休市日數，事後又未及時啟動穩定產銷因應措施，認為農委會與台北市政府皆有責任，更直指北農過去業務推廣的支出品項為威士忌，非相關農特產品，「此難以判定與業務推廣有關，支用顯於浮濫。」
北農於2018年春節期間連續休市，造成蔬菜價格猛烈下跌，當時引發爭議的前總經理吳音寧最終離開北農。根據監察院的最新調查報告，過去記載的業務推廣「贈貴賓禮盒」費用經會計師抽核發現，購買內容為威士忌，與推廣目的有所違和。
公共關係費部分，2016、2017年對於前主管或其親屬的逝世慰問金高達30萬元；而2017年報支的送禮經費，竟高達184萬1,310元，超過該年度實支數3成。調查報告指出，「究為何該公司對於其監督機關之公關贈禮經費竟如此之高？不免啟人疑竇。」
另外，2016年2月27日北農曾以業務推廣費1萬9千餘元購買9.12公噸蔬菜殘貨，贈送社福團體，此舉不符北農對蔬菜殘貨的處理機制，且未取得受贈團體的捐贈收據，導致事後無法核對受贈數量，有流向不明的疑慮。
當時農委會及臺北市政府身為主管機關，卻相互推卸責任、指責對方，並非政府機關面對危機應有的舉止，除希望政府機關能擔起職責外，監察院更表示，農委會及臺北市政府應督促北農訂定彈性休市機制，避免類似事件再次發生。
北農為總經理制，前兩任北農總經理，高雄市長韓國瑜任期從2013年1月至2017年3月，吳音寧則是2017年6月至2018年11月。（韓國瑜重啟核四拋兩前提 柯文哲：廢話）
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