后里居民隨後在律師協助下提出環評無效訴訟，健康風險成為雙方攻防重點。為了舉證，張豐年透過議員取得當地7、80份死亡證明，一一爬梳居民死因，再交由當時台北大學不動產與城鄉環境系副教授廖本全向家屬求證，最後證實多數死亡確實和癌症有關，進而推導出當地既有健康風險已經過高、並不適合再蓋科學園區的結論。
腫瘤惡化 兒子捐肝
「他們講過去豐興鋼鐵、正隆紙廠汙染很嚴重，隔壁多少人死掉是因為癌症啊，但沒辦法講出數據來…所以我蒐集到，告訴他們，這樣講話就比較有力道。」早年他在噪音陳情過程歷經證言不受重視的二度傷害，如今后里農民遇上相同遭遇，自然無法袖手旁觀。
「一般環保人士關心司法、程序不正義，這是沒有特定對象的，但張醫師是真的關心農民，以及那邊如果被破壞，對他們的影響是什麼…他特別關心這些人的命運。」朱淑娟觀察。
後來中科三期的環評結論，遭法院以未詳盡評估居民健康風險、未做二階環評等理由撤銷定讞，成為環評首例，也是台灣環境運動里程碑，無奈結局卻沒有因此改寫：後來中科三期補做二階環評，儘管農民、環團持續主張科學園區會排擠農業用水，2018年依舊通過審查。
時間回到2009年5月，鎮日環評會議和現勘行程，讓張豐年的肝再也撐不下去，腫瘤轉為惡性，雖然還未出現任何外部症狀，但切除、化療風險都高，唯有換肝能保命。二個兒子都願意捐肝，最後由身材相近的大兒子出線，捐出三分之二肝臟。
國內活體肝臟移植技術成熟，但大兒子腹腔傷口超過20公分，手術後仍有肝功能異常或復原不易等風險。張豐年表面上看來雲淡風清，開刀前一日和太太驅車南下高雄長庚醫院，途中遇到跨河路段，還要求停車拍照。「我當然唸他，說怎麼明天要換肝了你還這樣？生命交關，你能不能活過來還不知道欸！」江翠娥苦笑。
事實上他的不安都藏在心底。他在傳統家庭長大，對家人的情感表達含蓄，嘴上直說手術一定沒問題，但大兒子張書維卻透露，父親其實直到進手術房前一刻都還在游移：「那時候他表情看起來很不確定，很猶豫要不要讓我捐…最後我們同時進去，他就跟我說了句：『一切保重。』」一句「保重」已是張豐年少見流露情緒的時刻。
手術後，他固定以超音波儀確認兒子復原狀況，目前兒子的肝已長回正常大小。5年前，他在大兒子婚禮上致詞，終於第一次在眾人面前公開道謝。他嘴角漾著笑，略帶羞澀補充：「可是那天人太多了，我其實也不知道兒子的反應。」
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