ศาลปกครองสูงสุด มีคำสั่งยกคำร้องของศาลปกครองกลาง โดยให้ดำเนินการตามคำสั่งชี้ขาด ของคณะอนุญาโตตุลาการ ให้กระทรวงคมนาคมโดยการรถไฟแห่งประเทศไทยจ่ายคืนเงินค่าก่อสร้างและค่าใช้จ่ายอื่นๆ แก่ บริษัทโฮปเวลล์ รวม 11,888 ล้านบาทและดอกเบี้ยอีก 7.5 เปอร์เซ็นต์ต่อปี คืนให้กับบริษัทครบแล้วทั้งหมด และให้ดำเนินการแล้วเสร็จภายใน 180 วัน