2025 東京馬拉松可謂高手雲集，在受邀選手中，有11人曾經跑入2小時05分以內，其中包括上屆冠軍、肯尼亞名將 Benson Kipruto。Kipruto 去年以2小時2分16秒奪冠，不僅刷新個人最佳時間，亦成為日本境內馬拉松最快紀錄。
另外，2024 巴黎奧運10,000公尺金牌得主 Joshua Cheptegei 亦會參賽，他亦是 10,000米與5,000米世界紀錄保持者。日本國內則有巴黎奧運馬拉松第6名赤崎曉，以及擁有2小時5分台最佳紀錄的池田耀平受邀出戰。
不過，實力選手大迫傑及設樂悠太將會避戰。
東京マラソン欠場します。
— 設楽 悠太 (@yuta_shitara) February 28, 2025
日本國內焦點之一落在青山學院大學四年級生太田蒼生，這位年輕跑者連續四年出戰箱根駅傳，曾兩度獲得區間獎，尤其在今年箱根駅傳往路第4區 (21.4公里)，成為首位跑進59分的日本選手，創下歷史性突破。
近年，日本長跑界掀起「青山學院旋風」。2月2日的別府大分每日馬拉松，青山學院四年級生若林宏樹，以2小時6分7秒摘下亞軍，刷新初次馬拉松日本最佳紀錄與日本學生紀錄。緊接著2月24日的大阪馬拉松，三年級生黑田朝日跑出2小時6分5秒，再度打破若林剛創下的學生紀錄。這兩位跑者分別以「退役賽」(按: 若林宏樹早前已宣布畢業後退役) 和「駅傳為主」的態度參賽，而太田則不同，他計劃畢業後加入GMO互聯網集團，正式轉戰馬拉松。
根據 Weathernews 分析，東京馬拉松比賽當天無降雨預報，風速也較為和緩，而起跑時氣溫預計為13℃左右，到市民跑者陸續抵達終點時，氣溫可能攀升至20℃上下。雖然未達夏季酷暑程度，但仍算較為和暖。
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