大型診所愈開愈多，每年申報健保的費用直逼地區醫院，卻不用像醫院一樣接受評鑑。為保障民眾就醫品質，健保署將於2026年針對年領健保費用破億元的診所開辦「診所評鑑」，以後沒通過評鑑的診所，就不能與健保特約。
近5年診所增加500多間，科別及執行手術多了，風險和爭議隨之而來。某大型連鎖婦幼診所2023年有醫師在進行子宮鏡手術時，使用器具不慎刺穿女病患的子宮與右側髂動脈，導致其大出血、不治身亡，2024年11月判決出爐，引發社會大眾對於診所醫療品質的疑慮。
當時，林口長庚醫院院長陳建宗就透過媒體提醒，最大的問題在於「如今國內診所的規模愈開愈大，且執行手術項目也愈來愈多，但訓練時數不像大醫院要求。」
「醫院評鑑」一直是監督醫療品質的重要手段，目前診所沒有實施評鑑。健保署署長石崇良表示，預計1個多月後預告修法，2026年起，年領取健保費用超過1億元的診所也要跟醫院一樣，每4年接受一次「診所評鑑」，估計約28家診所受影響。
少數診所年領健保上億元，規模直逼地區醫院
依照「全民健康保險醫事服務機構提報財務報告辦法」，一年領取健保費用2億元以上的醫療機構必須依法公布財報，今年僅3家診所（遠東聯合診所、書田泌尿科診所、安慎診所）上榜。為什麼診所評鑑的門檻要下修到1億元？
石崇良說，地區醫院年均申報中位數是1.2億元，都要接受評鑑了，一間診所一年申報超過1億，接受評鑑也合理。目前初步估計，大約有28家診所已達此營運規模，包括手術安全、用藥安全、感染控制、輻射檢驗、檢體污染等醫療品質重要指標，都會列入評鑑基準。
超級大戶才會被評鑑，99%診所不受影響
健保署預計在農曆年後（2025年2月）就會預告新制，2026年開始評鑑， 之後與醫院一樣每4年評估一次，如果評鑑不過，健保就不會與該診所特約。
中華民國診所協會全國聯合會榮譽理事長陳宏麟表示，一般診所一個月能申報幾百萬元就是大戶，一年能申報到1億的診所，換算單月申報800萬，絕非一般規模，一定是有很高價的特殊處置，或是服務量極大，「這樣的診所，應該只有佔1%，絕大部分的基層醫師是不會受到影響的。」