今年公費疫苗原定今日（10/1）開打，不過卻遇到山陀兒颱風襲台，其中高雄、台南、屏東、台東等已至少4縣市宣布停班停課，因此疫苗施打日也將順延至颱風假結束，疾管署副署長羅一鈞也表示，這次是史上第一次秋冬公費疫苗開打日遇上縣市颱風假。
疾病管制署副署長羅一鈞表示，疫苗接種計劃有提及，疫苗接種期間縣市政府若遇到颱風假，疫苗接種站取消，醫院接種服務也都暫停，待颱風假取消之後再恢復，至於正常上班上課的縣市，羅一鈞表示，原則照常開打，但如鄉鎮市區停班停課或社區接種站、院所因特殊情況無法按原訂計畫提供接種，會由各地方政府另行公布周知。
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根據疾管署規劃今年秋冬流感、新冠疫苗同步於10月1日起分階段開打，第一階段對象包括65歲以上長者、學齡前幼兒、醫事及衛生防疫相關人員等11類等高風險、高傳播族群。
疾管署說明，為配合今年新冠、流感疫苗首度同時開打，特別於宣導主視覺中呈顯雙重保護的意象，代表2種疫苗的防護罩保護著接種民眾，抵擋新冠、流感病毒侵襲；而搭配「左流右新，健康安心」口號，也讓民眾易於記憶，左手接種流感疫苗，右手接種新冠疫苗，一次完成2種接種疫苗，保護自己免於新冠、流感威脅，健康、安心過秋冬。
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另因應今年有3,843家新冠、流感疫苗合約院所，為避免民眾選擇接種院所時混淆，疾管署亦製作4款布條提供地方衛生局及疫苗合約院所使用，除用於宣導新冠、流感疫苗開打的「橘色款」外，還有針對不同合約院所製作3款布條，2,914家提供新冠及流感疫苗院所為「藍色款」、882家僅提供流感疫苗院所為「紫色款」、47家僅提供新冠疫苗院所為「綠色款」，各院所可將布條刊掛門口，方便民眾一眼辨識。