114年全民健康保險總額預算核定，是歷年成長金額最高的一年，卻遭批評「直接政治決定、政治凌駕專業」。邱泰源表示，5.5%是國發會核可的最高點，不過難以達到立法院通過的主決議，年中前平均點值達1點0.95元的目標。
社保司日前公布幾年健保總額，成長率達5.5％，不過，醫療改革基金會分析，若加上「111億元移除總額改由公務預算支應」、「20億元罕見疾病藥費」等，實質成長率為8.24％。
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另此次總額基期的算法開了特例，補入前2年度投保人口預估成長率與實際的差值、未扣減扣沒執行的預算，成長率有被低估的疑慮。社保司始終沒有具體回應背後的科學評估依據，直接政治決定，是政治凌駕專業。
對此，根據《 ETtoday健康雲》報導，衛福部部長邱泰源受訪表示，現在醫療需求越來越多，且醫療水準要求也要保持國際水準，衛福部也積極納入新科技，尤其是罕病，過去無法提早讓罕病及早用藥，未來會特別加強，另外還有精神科長效針劑、急重難罕、偏鄉醫療和留住醫護人員等，都需要更多支持。
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邱泰源強調，這次5.5％成長率，是國發會核可的最高點，但即使這次達到5.5％，也還沒辦法可以完全滿足醫院、醫療人員的需求，甚至也很難達到去年立法院通過的主決議，健保平均總額在今年6月30日之前要達到1點0.95元的目標，因此行政院也盡量挪出公務預算，給他們資源照顧人民的健康。