武漢新型冠狀病毒疫情爆發接近3個月，病毒何時被發現至今仍是謎團。《財新網》今日報道，湖北省衛健委曾在1月1日致電予一名基因測序公司人士，要求將病例樣本銷毀；中科院武漢病毒所都一度被要求停止病原檢測，銷毀已有樣本。報道又翻查多份文件，發現早於去年12月27日已組裝出「接近完整的病毒基因組序列」，數據亦分享給中國醫學科院病原所，武漢醫院、疾控中心領導已知悉當時有多宗類似個案。
翻查資料，中國疾控中心1月9日宣布病原體為新型冠狀病毒；1月11日中國首次將病毒基因組序列在病毒學組織Virologic.org網站及GenBank分享，及向世界衛生組織提交病毒基因組序列信息，在全球流感共享資料庫GISAID發佈。
《財新網》引述一名基因測序公司人士透露，今年1月1日該人士接到湖北省衛健委一位官員電話，通知他武漢如有新冠狀病毒的病例樣本送檢，不能再檢；已有的病例樣本必須銷毀，不能對外透露樣本信息，不能對外發布相關論文和相關數據，「如果你們在日後檢測到了，一定要向我們報告。」
直至1月3日，國家衛健委辦公廳發布一份名為《關於在重大突發傳染病防控工作中加強生物樣本資源及相關科研活動管理工作的通知》，犒稱針對武漢肺炎病例樣本，在進一步明確病原信息之前，暫按照高致病性病原微生物（第二類）進行管理，更規定未經批准，不得擅自向其他機構和個人提供生物樣本及其相關信息。
文件又稱，若機構和個人已從有關醫療衛生機構取得相關病例生物樣本，應立即將樣本就地銷毀或送交國家指定的保藏機構保管，亦不得擅自對外發布有關病原檢測或實驗活動結果等信息。
有病毒學家向《財新網》透露，中科院武漢病毒所都一度被要求停止病原檢測，銷毀已有樣本，「因為按現行《傳染病防治法》，開展傳染病實驗室檢測、診斷、病原學鑒定是各級疾病預防控制機構的法定職責，僅有國家和省級的疾控系統機構才有權進行傳染病病原學鑒定，中科院武漢病毒所顯然不在此列，更何況那些未經授權的商業科研機構」。
基因圖譜早在12月27日發現 武漢醫院、疾控中心領導知悉多宗類似患者
至於病毒基因圖譜何時被發現，報道指可追溯至去年12月15日，一名65歲的華南海鮮市場男性送貨員開始發燒，3日後到武漢市中心醫院急診科求醫，起初判斷是社區獲得性肺炎。
惟病人12月22日病情加重，進入深切治療送治療，病人對各種抗生素治療無效。報道訪問武漢市中心醫院呼吸內科主任醫師趙蘇，指12月24日有醫生為病人採集病毒樣本，送至第三方檢測機構「廣州微遠基因科技有限公司」進行檢測，進行第二代高通量基因測序技術，找出病原體。
《財新網》指，微信公號「微遠基因」引述一篇中華醫學雜志的論文，及微信公號「小山狗」的一篇題為「記錄一下首次發現新型冠狀病毒的經歷」的文章，兩篇文章均談及1名65歲患者，指他去年12月15日發燒，透過基因測序技術顯示病人的樣本，與沙士相似度達94.5%，詳細分析後指病原體與「Bat SARS like coronavirus（蝙蝠類沙士病毒）最相似。」
報道指，廣州微遠基因科技有限公司12月27日「組裝出了接近完整的病毒基因組序列」，數據同時分享給中國醫學科院病原所，「基本可以確認這個患者的樣本裡面確實有一個跟Bat SARS like coronavirus類似的新型病毒。」
「小山狗」的文章談及，12月27日、28日該公司領導跟醫院、疾控部門電話溝通，29日、30日甚至親自去武漢與醫院、疾控中心領導當面匯報交流所有分析結果，「此時醫院和疾控的人早已經知道有多名類似患者，我們溝通了檢測結果之後已經開始了應急處理。」
最早完成基因測序的樣本男病人，之後在金銀潭醫院不治身亡，但已檢測出新型病毒的研究成果，在當時未起到任何作用。
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