香港目前有16個堆填區，13個面積相對較小的堆填區，在1960至1988年期間啟用，但已在1975至1996 年期間關閉，需要進行特定而有效的修復工作。由於堆填區內的廢物會持續進行生物降解，並產生堆填氣體和滲濾污水，因此會對周圍的環境和安全產生風險，而降解過程也會令堆填區出現不平均地面沉降。
滲濾污水為高度污染物，由固體廢物滲出的液體，由廢物中的水份、廢物的分解過程和滲入廢物的雨水所產生，如果控制不當，可能會直接排入水體，造成嚴重污染。
審計報告調查發現「望后石谷堆填區」問題多，不但有承建商沒有遵從法定和合約要求辦事，污水廠未能正常運作，無法有效率地處理滲濾污水，曾經在雨量大的時候，達警戒水平。
審計報告指出，2016 年年初，環保署發現望后石谷堆填區的滲濾污水廠未能正常運作，無法有效率地處理滲濾污水。2016 年 5 月至 2017 年 11 月期間，有 347 天未有遵從有關滲濾污水廠處理能力的要求。 及後，該署指示承建商A對滲濾污水廠進行整體維修，務求解決問題。
2017 年 7 至 11 月期間，主要由於雨量很大，流進望后石谷堆填區的滲濾污水，遠超該滲濾污水廠的處理能力，令滲濾污水儲存缸的水位達到警戒水平。因此，承建商 A 在環保署同意下，用車輛把滲濾污水直接送往政府的其他設施作場外處理。
環保署在2016 年 1 至 4 月期間接獲投訴，其後調查發現，承建商 A 違反了一些載於望后石谷堆填區牌照的法定要求，例如「堆填氣體處理系統的運作溫度低於合約要求」、「排入污水渠的滲濾污水不符合標準」，總共扣減了大約 770 萬元。
承建商 A 在 2017 年 10 月告知環保署，由於望后石谷堆填區的滲濾污水雜質濃度較高，導致未經處理的滲濾污水水質變差，因而影響滲濾污水廠的處理效率，導致滲濾污水廠需要經常停運保養。2017 年 11 月，承建商 A在滲濾污水廠上游位置安裝了一套預先處理系統，務求緩解問題。審計署認為，在改善望后石谷堆填區滲濾污水廠的處理效率方面，環保署需要監察滲濾污水預先處理系統的效益。
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