本港爆發第三波武漢肺炎疫情，當中或涉及社區群組爆發，然而書展仍如期在 7 月 15 日至 21 日舉行，坊間不少聲音表示憂慮。受疫情影響，書展內不少活動自發取消，包括青年協會主辦的「全港即興創意寫作比賽」頒獎禮，以及一些作家如漫畫家 Cuson Lo 的簽名會。
對書展如期舉行，公民黨議員郭家麒表示感到「離譜」和「失望」，批評政府「不負責任」。他又指，若書展有超級帶病毒者，香港醫療系統或難以負荷。
書展中一些活動，已因疫情影響取消或調整。青年協會主辦的「全港即興創意寫作比賽」，原定於周三至四舉行總決賽，周日在書展頒獎，青協表示，總決賽、頒獎禮將取消。漫畫家 Cuson Lo 亦表示，「基於考慮到公眾健康為理由」，書展簽名活動取消。「這是迫不得已的決定，希望各位體諒」。
貿發局重申，會首要考慮與會者及書迷安全，密切注意事態，並跟從衛生防護中心指引。食物及衛生局長陳肇被問到在書展出現確診如何追蹤時，則表示大型活動都有風險，重要是注意人與人之間保持距離和人流控制。
早前，由參展中小微企代表組成的「2020 香港書展關注組」發聲明，指過去 10 年，每年書展均有約百萬讀者入場，人流集中，對如期舉辦書展感到憂慮，為公眾健康、業界權益著想，建議政府及貿易發展局重新考慮延辦書展。關注組引述政府專家顧問、中大呼吸系統科講座教授許樹昌建議，假如疫情失控「最理想是今年不要舉辦書展」，指全球多個大型書展在武漢肺炎疫情下已宣佈延期、停辦，促請政府重新考慮。
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